RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 OR13C8Q8NGS7 320 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 LINC00476Q8WZB0 136 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 GGTLC1Q9BX51 225 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 HRASLSQ9HDD0 168 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 TMEM14BQ9NUH8 114 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 FBXL7Q9UJT9 491 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 ZNF320A2RRD8 509 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 OR2C1O95371 312 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 DHFRP00374 187 aa9.26□□□□□ -0.93
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PRAME-204ENST00000403441 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 CBLN1P23435 193 aa9.26□□□□□ -0.93
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PRAME-204ENST00000403441 ARL3P36405 182 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 PIGPP57054 158 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 ANKRD55Q3KP44 614 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 FAM106AQ4KMX7 169 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 FAAP20Q6NZ36 180 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 C19orf35Q6ZS72 473 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 TMEM61Q8N0U2 210 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 OR52B4Q8NGK2 314 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 ZFAND1Q8TCF1 268 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 TP53RKQ96S44 253 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 GPR132Q9UNW8 380 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 ALMS1Q8TCU4 4167 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 NUPR2A6NF83 97 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 CCDC160A6NGH7 325 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 DBX1A6NMT0 343 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 C15orf61A6NNL5 157 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 B3GALNT1O75752 331 aa9.25□□□□□ -0.93
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PRAME-204ENST00000403441 PI3P19957 117 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 EDN2P20800 178 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 UCP1P25874 307 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 PPP5CP53041 499 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 ERVK-16P61578 105 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 WT1-ASQ06250 92 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 GPHB5Q86YW7 130 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 GDPD1Q8N9F7 314 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 MARCH1Q8TCQ1 289 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 DEDD2Q8WXF8 326 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 CACNG8Q8WXS5 425 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 TSC22D3Q99576 134 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 PRRT1Q99946 306 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 COMMD5Q9GZQ3 224 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 C5orf66Q9H5L9 145 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 A8MWP6 167 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 DISC1C4P0D8 188 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 IGKV1-5P01602 117 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 IGHV3-23P01764 117 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 PGAM2P15259 253 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 PMS2P11Q13670 270 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 AARDQ4LEZ3 155 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 CLEC19AQ6UXS0 136 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 OR10W1Q8NGF6 305 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 OR1L8Q8NGR8 309 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 OR5B3Q8NH48 314 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 CCDC140Q96MF4 163 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 OVOL2Q9BRP0 275 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 FKBP11Q9NYL4 201 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 NDUFA13Q9P0J0 144 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 PRNDQ9UKY0 176 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 TMEM213A2RRL7 107 aa9.23□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 INS-IGF2F8WCM5 200 aa9.23□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 NDUFB8O95169 186 aa9.23□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 CDS2O95674 445 aa9.23□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 SERPINE2P07093 398 aa9.23□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 TRAPPC2P0DI81 140 aa9.23□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 TRAPPC2BP0DI82 140 aa9.23□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa9.23□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 UXS1Q8NBZ7 420 aa9.23□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 OR51S1Q8NGJ8 323 aa9.23□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 GLYATL2Q8WU03 294 aa9.23□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 TMEM222Q9H0R3 208 aa9.23□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 MLXQ9UH92 298 aa9.23□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 SELENOKQ9Y6D0 94 aa9.23□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa9.22□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa9.22□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 REG1AP05451 166 aa9.22□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 DEFA4P12838 97 aa9.22□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 S100A5P33763 92 aa9.22□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 MFAP2P55001 183 aa9.22□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 APOC4P55056 127 aa9.22□□□□□ -0.93
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