RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382998.8

CTIF-202, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 4,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-202ENST00000382998 EGR1P18146 543 aa11.64□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 C1orf195Q5TG92 126 aa11.64□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 PPDPFQ9H3Y8 114 aa11.64□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 NCOR2Q9Y618 2525 aa11.64□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 A0A1B0GW64 132 aa11.64□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 H3BMG7 143 aa11.64□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 LILRA1O75019 489 aa11.64□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 CD55P08174 381 aa11.64□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 IL36GQ9NZH8 169 aa11.64□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 PIGLQ9Y2B2 252 aa11.64□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 THADAQ6YHU6 1953 aa11.64□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 DOCK4Q8N1I0 1966 aa11.64□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 K7N7A8 449 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 PAX1P15863 534 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 PPIFP30405 207 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 RPL27P61353 136 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 OR10J3Q5JRS4 329 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 PRADC1Q9BSG0 188 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 RPRMQ9NS64 109 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 ZNF260Q3ZCT1 412 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 ZDHHC16Q969W1 377 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 FRG2CA6NGY1 282 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 AGFG2O95081 481 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 WNT2P09544 360 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 FCGR2AP12318 317 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 CRYBA2P53672 197 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 PAX9P55771 341 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 EDDM3BP56851 147 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 KLRD1Q13241 179 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 IL36BQ9NZH7 164 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 LRRC30A6NM36 301 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 K7EN84 100 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 ZNF137PP52743 207 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 CD300LDQ6UXZ3 194 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 RPS4Y2Q8TD47 263 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 MGST2Q99735 147 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 FBXL15Q9H469 300 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 H3BTX0 84 aa11.62□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 NPFFO15130 113 aa11.62□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 PFN1P07737 140 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 SPACA5Q96QH8 159 aa11.62□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 PROCRQ9UNN8 238 aa11.62□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 PRSS37A4D1T9 235 aa11.62□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 COX6CP09669 75 aa11.62□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 CT62P0C5K7 136 aa11.62□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 NRN1LQ496H8 165 aa11.62□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 BRK1Q8WUW1 75 aa11.62□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 ORM1P02763 201 aa11.62□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 PCBD1P61457 104 aa11.62□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa11.62□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 ACACBO00763 2458 aa11.61□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 FAM181BA6NEQ2 426 aa11.61□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 TSPO2Q5TGU0 170 aa11.61□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa11.61□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 RPEQ96AT9 228 aa11.61□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa11.61□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 FOXF1Q12946 379 aa11.61□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 WFDC2Q14508 124 aa11.61□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 LIAT1Q6ZQX7 453 aa11.61□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 HSPB6O14558 160 aa11.61□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 NABP2Q9BQ15 211 aa11.61□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 EPDR1Q9UM22 224 aa11.61□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 PATJQ8NI35 1801 aa11.61□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 PCNTO95613 3336 aa11.61□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa11.61□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 OPRK1P41145 380 aa11.61□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 VOPP1Q96AW1 172 aa11.61□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 A0A096LPE4 126 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 A0A1W2PPZ6 126 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 C5orf49A4QMS7 147 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 GUSBP1Q15486 140 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 ST8SIA1Q92185 356 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 RASL10BQ96S79 203 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 FOXS1O43638 330 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 IGLV3-19P01714 112 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 ZNF883P0CG24 379 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 DNAJC30Q96LL9 226 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 DUX3Q96PT4 197 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 RASL11BQ9BPW5 248 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 AP5S1Q9NUS5 200 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 SCN2AQ99250 2005 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 A0A0G2JK05 382 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 MT-ATP8P03928 68 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 PTGDSP41222 190 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 HOGA1Q86XE5 327 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 TIAF1O95411 115 aa11.59□□□□□ -0.55
CTIF-202ENST00000382998 FXYD3Q14802 87 aa11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 141.7 ms