RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365280.1

RNU6-407P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 407, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-407P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-407P-201ENST00000365280 NAV3Q8IVL0 2385 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 TNCP24821 2201 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 ALPK3Q96L96 1907 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 A0A0D9SG52 128 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 C2orf70A6NJV1 201 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 IQCF5A8MTL0 148 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 BIRC5O15392 142 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 BAALC-AS2P0C853 105 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 FAM228BP0C875 321 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 C8orf88P0DMB2 117 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 COX6A1P12074 109 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLC51BQ86UW2 128 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 C10orf67Q8IYJ2 551 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 SYCE1Q8N0S2 351 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 PFN4Q8NHR9 129 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 C4orf3Q8WVX3 66 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 KCTD7Q96MP8 289 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLC50A1Q9BRV3 221 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 HDHD2Q9H0R4 259 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 EFCAB1Q9HAE3 211 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 CISHQ9NSE2 258 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 PLAC8Q9NZF1 115 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 DKKL1Q9UK85 242 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 KIF13BQ9NQT8 1826 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF462Q96JM2 2506 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 RIC1Q4ADV7 1423 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 FRAS1Q86XX4 4008 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 A0A1B0GV50 99 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 HSBP1L1C9JCN9 74 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 SMLR1H3BR10 107 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 SSNA1O43805 119 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 ASAH2BP0C7U1 165 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 RD3LP0DJH9 198 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 UGT2B7P16662 529 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 CNBPP62633 177 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 RHOGP84095 191 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 MED21Q13503 144 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 SPANXN3Q5MJ09 141 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 CST9Q5W186 159 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 TMEM156Q8N614 296 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 DEFB125Q8N687 156 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 SCGB3A1Q96QR1 104 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 ACER3Q9NUN7 267 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 RASL12Q9NYN1 266 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 ABCC11Q96J66 1382 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 TRPC5OSA6NMA1 111 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR2B3O76000 313 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 UBL3O95164 117 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 MYL12AP19105 171 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 PSMB6P28072 239 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 MARCKSL1P49006 195 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 MAP3K7CLP57077 242 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 KISS1Q15726 138 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 KCNJ8Q15842 424 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 MPV17LQ2QL34 196 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 OOSP2Q86WS3 158 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR13C4Q8NGS5 318 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 MCFD2Q8NI22 146 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 CNBD2Q96M20 576 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 PRRT1Q99946 306 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 DERL1Q9BUN8 251 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 FAM96AQ9H5X1 160 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 TAS2R4Q9NYW5 299 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 TOPBP1Q92547 1522 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 MTUS2Q5JR59 1369 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 DOCK3Q8IZD9 2030 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 E9PCH4 1651 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 ERICH2A1L162 156 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 FABP12A6NFH5 140 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 F5H768 121 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 NCR3O14931 201 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 TCL1BO95988 128 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 UCHL3P15374 230 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 HIST1H2BOP23527 126 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 HIST1H2BBP33778 126 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 HIST1H2BDP58876 126 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 HIST1H2BCP62807 126 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 PPP1R1AQ13522 171 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 HIST2H2BEQ16778 126 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 AADACL3Q5VUY0 350 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 DPPA3Q6W0C5 159 aa-0.04□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms