RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 AREGP15514 252 aa21.66■■□□□ 1.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 NPY1RP25929 384 aa21.66■■□□□ 1.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAB11AP62491 216 aa21.66■■□□□ 1.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 LFNGQ8NES3 379 aa21.66■■□□□ 1.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 ESM1Q9NQ30 184 aa21.66■■□□□ 1.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 F8P00451 2351 aa21.66■■□□□ 1.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR8U8P0C7N1 319 aa21.65■■□□□ 1.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 HKR1P10072 659 aa21.65■■□□□ 1.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM252Q8N6L7 170 aa21.65■■□□□ 1.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM68Q96MH6 324 aa21.65■■□□□ 1.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 AQP10Q96PS8 301 aa21.65■■□□□ 1.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 ECSCRQ19T08 205 aa21.65■■□□□ 1.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa21.65■■□□□ 1.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR4C12Q96R67 309 aa21.65■■□□□ 1.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 FBXO7Q9Y3I1 522 aa21.65■■□□□ 1.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLXNB1O43157 2135 aa21.64■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGSF23A1L1A6 192 aa21.64■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 LINC01548A6NM66 108 aa21.64■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 IFNA4P05014 189 aa21.64■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 CRYBA1P05813 215 aa21.64■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 METTL15P1P0C7V9 234 aa21.64■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 DEFA4P12838 97 aa21.64■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2F1Q13607 317 aa21.64■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 AP4M1O00189 453 aa21.63■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP21.63■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa21.63■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A0D9SG52 128 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM181BA6NEQ2 426 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 C15orf62A8K5M9 175 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 CYB5BO43169 146 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 TCF21O43680 179 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 CST7O76096 145 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 SULT1A1P50225 295 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 BAXQ07812 192 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 C2orf83Q53S99 150 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 P2RX4Q99571 388 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 MTORP42345 2549 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRAV41A0A0B4J266 112 aa21.61■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF222A6NCQ9 220 aa21.61■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 NPIPB5A8MRT5 1133 aa21.61■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGF1P05019 195 aa21.61■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPL15P61313 204 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 UBA52P62987 128 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF345Q14585 488 aa21.61■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 AKIRIN2Q53H80 203 aa21.61■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR8G2PQ6IF36 304 aa21.61■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 Q6ZS46 218 aa21.61■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 TTC9CQ8N5M4 171 aa21.61■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF114Q8NC26 417 aa21.61■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZFHX3Q15911 3703 aa21.61■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 CTRB1P17538 263 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 HBG1P69891 147 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 HBG2P69892 147 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 NHLH2Q02577 135 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 BSXQ3C1V8 233 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 CTRB2Q6GPI1 263 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 ETV3LQ6ZN32 361 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM217Q8N7C4 229 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR5T1Q8NG75 326 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR10P1Q8NGE3 313 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR1L6Q8NGR2 347 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 WNT10AQ9GZT5 417 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 HSPB11Q9Y547 144 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 CXCL2P19875 107 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 ASPHD1Q5U4P2 390 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR1P1Q8NH06 330 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 CRYGCP07315 174 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 C4BPBP20851 252 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC25A24Q6NUK1 477 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 C9orf62Q8N4C0 152 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCNRGQ8N5I3 272 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARL6Q9H0F7 186 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF702PQ9H963 129 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 LINC00527Q9UJ94 153 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 G3V318 75 aa21.58■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 FBXO24O75426 580 aa21.58■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR1S2Q8NGQ3 325 aa21.58■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 S100A11P31949 105 aa21.57■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMUB2Q71RG4 321 aa21.57■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 LILRB2Q8N423 598 aa21.57■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM170AQ8WVE7 144 aa21.57■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 GON7Q9BXV9 100 aa21.57■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa21.57■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa21.56■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 CORTO00230 105 aa21.56■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 STPG2Q8N412 459 aa21.56■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 MISP3Q96FF7 219 aa21.56■■□□□ 1.04
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