RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 USF1P22415 310 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 ERHP84090 104 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 CLEC12BQ2HXU8 276 aa15.94■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa15.94■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM186Q96B77 213 aa15.94■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 NABP2Q9BQ15 211 aa15.94■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 DSPP15924 2871 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa15.93■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 DVL1O14640 695 aa15.93■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 IL3RAP26951 378 aa15.93■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 PQLC2Q6ZP29 291 aa15.93■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF114Q8NC26 417 aa15.93■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF596Q8TC21 504 aa15.93■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 RND1Q92730 232 aa15.93■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa15.93■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM106BQ9NUM4 274 aa15.93■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 A0A1W2PN81 502 aa15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 TAS2R45P59539 299 aa15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 RPL8P62917 257 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 PDPNQ86YL7 162 aa15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 OR10G8Q8NGN5 311 aa15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 OR4C13Q8NGP0 309 aa15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 ZFHX4Q86UP3 3567 aa15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 A0A0U1RQK1 487 aa15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF320A2RRD8 509 aa15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 CCL3L1P16619 93 aa15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 CD69Q07108 199 aa15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 GAMTQ14353 236 aa15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 OR10X1Q8NGY0 326 aa15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 SGMS2Q8NHU3 365 aa15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 OCC1Q8TAD7 63 aa15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 ZNRD1Q9P1U0 126 aa15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 DLL1O00548 723 aa15.91■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 TEX38Q6PEX7 206 aa15.91■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 OR5R1Q8NH85 324 aa15.91■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM37Q8WXS4 190 aa15.91■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 CCL17Q92583 94 aa15.91■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 PLCE1Q9P212 2302 aa15.91■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 FOXH1O75593 365 aa15.91■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 SSX2Q16385 188 aa15.91■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 MIR17HGQ75NE6 70 aa15.91■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 Q8NA96 180 aa15.91■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa15.91■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 RNF2Q99496 336 aa15.91■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 KAAG1Q9UBP8 84 aa15.91■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 SSUH2Q9Y2M2 353 aa15.91■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 OR5G3P0C626 314 aa15.9■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 SFTPCP11686 197 aa15.9■□□□□ 0.14
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SPNS1-201ENST00000311008 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 PGPEP1LA6NFU8 196 aa15.9■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 AMBPP02760 352 aa15.9■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 PSG5Q15238 335 aa15.9■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
SPNS1-201ENST00000311008 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa15.9■□□□□ 0.14
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SPNS1-201ENST00000311008 ZNF137PP52743 207 aa15.89■□□□□ 0.13
SPNS1-201ENST00000311008 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
SPNS1-201ENST00000311008 HLA-DRB5Q30154 266 aa15.89■□□□□ 0.13
SPNS1-201ENST00000311008 PRDM13Q9H4Q3 707 aa15.89■□□□□ 0.13
SPNS1-201ENST00000311008 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
SPNS1-201ENST00000311008 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa15.88■□□□□ 0.13
SPNS1-201ENST00000311008 CHRNB4P30926 498 aa15.88■□□□□ 0.13
SPNS1-201ENST00000311008 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP15.88■□□□□ 0.13
SPNS1-201ENST00000311008 WASHC3Q9Y3C0 194 aa15.88■□□□□ 0.13
SPNS1-201ENST00000311008 A0A087X0M5 115 aa15.88■□□□□ 0.13
SPNS1-201ENST00000311008 A0A1B0GX30 115 aa15.88■□□□□ 0.13
SPNS1-201ENST00000311008 RBPJQ06330 500 aa15.88■□□□□ 0.13
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SPNS1-201ENST00000311008 DYNLRB1Q9NP97 96 aa15.88■□□□□ 0.13
SPNS1-201ENST00000311008 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa15.88■□□□□ 0.13
SPNS1-201ENST00000311008 ICE1Q9Y2F5 2266 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-201ENST00000311008 FCN3O75636 299 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-201ENST00000311008 MC5RP33032 325 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-201ENST00000311008 OR10W1Q8NGF6 305 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-201ENST00000311008 OR9G1Q8NH87 305 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-201ENST00000311008 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM18Q96B42 140 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-201ENST00000311008 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-201ENST00000311008 IL36BQ9NZH7 164 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-201ENST00000311008 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-201ENST00000311008 C8orf88P0DMB2 117 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-201ENST00000311008 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-201ENST00000311008 CDPF1Q6NVV7 123 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-201ENST00000311008 MOB3BQ86TA1 216 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-201ENST00000311008 FAM122AQ96E09 287 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-201ENST00000311008 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-201ENST00000311008 A0A1W2PRE2 83 aa15.86■□□□□ 0.13
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