RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 OR10J3Q5JRS4 329 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 CEP290O15078 2479 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 MED12Q93074 2177 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 IZUMO1RA6ND01 250 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 SPINK4O60575 86 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 CHRNB4P30926 498 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 ADMP35318 185 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 CA7P43166 264 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 TCL1AP56279 114 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 PMCHL1Q16048 86 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 CYB5R2Q6BCY4 276 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 Q6ZR03 302 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 Q8TCH9 128 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 YPEL4Q96NS1 127 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 FER1L5A0AVI2 2057 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 ADAMTS20P59510 1910 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 A8MWL6 223 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 CCL8P80075 99 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 GCSAMLQ5JQS6 135 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 ASCL3Q9NQ33 180 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 M0R2Z0 102 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 RASL11AQ6T310 242 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 BLNKQ8WV28 456 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 IGHV1-46P01743 117 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 TFF1P04155 84 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 CBLN1P23435 193 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 OR8B3Q8NGG8 313 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 ZNF596Q8TC21 504 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 OR8B2Q96RD0 313 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 PRO3102Q9H379 93 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 SDK2Q58EX2 2172 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 P0C879 139 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 FAM216BQ8N7L0 139 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 VN1R17PQ8TDU5 208 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 GAFA1Q96PS6 74 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 AAMDCQ9H7C9 122 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 TNFRSF19Q9NS68 423 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 TMEM14BQ9NUH8 114 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 INSIG2Q9Y5U4 225 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 TRAV34A0A0B4J273 112 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 C17orf100A8MU93 164 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 RBP4P02753 201 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 LGALS4P56470 323 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 RIGQ13278 110 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 IGFL2Q6UWQ7 119 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 PNKDQ8N490 385 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 PMS2P5A8MQ11 134 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 POU2AF1Q16633 256 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 ZNF600Q6ZNG1 722 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 KCNS1Q96KK3 526 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 RASL11BQ9BPW5 248 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 FAM186AA6NE01 2351 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 LYZP61626 148 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 DOLPP1Q86YN1 238 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 TMEM106BQ9NUM4 274 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 PEX7O00628 323 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 COTL1Q14019 142 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 HES1Q14469 280 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 TNFRSF14Q92956 283 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 TRAV3A0A0B4J244 114 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 SLC17A3O00476 420 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 REG1BP48304 166 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 MFAP2P55001 183 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 NEUROG1Q92886 237 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 C11orf52Q96A22 123 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 NDFIP1Q9BT67 221 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 RAB1BQ9H0U4 201 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 A0A1B0GV90 55 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 FMC1Q96HJ9 113 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 C2orf88Q9BSF0 95 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 TPPP3Q9BW30 176 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 SCNM1Q9BWG6 230 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 THYN1Q9P016 225 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 GRIFINA4D1Z8 144 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 GZMBP10144 247 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 TBR1Q16650 682 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 AARDQ4LEZ3 155 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 C1orf194Q5T5A4 169 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 ZNF788Q6ZQV5 615 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 SMIM15Q7Z3B0 74 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 TEX45Q8NA69 505 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 NPIPB3Q92617 1050 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 ONECUT1Q9UBC0 465 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 B9A039 149 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 TNFSF13O75888 250 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms