RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215941.8

ANKRD54-201, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD54, Length 2,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-201ENST00000215941 PMCHL1Q16048 86 aa18.76■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 Q6ZT83 130 aa18.76■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 MIR17HGQ75NE6 70 aa18.76■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 RNF114Q9Y508 228 aa18.76■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF318Q5VUA4 2279 aa18.76■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 ORAOV1Q8WV07 137 aa18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 ADTRPQ96IZ2 230 aa18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 NABP2Q9BQ15 211 aa18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 C20orf202A1L168 122 aa18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 IZUMO1RA6ND01 250 aa18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 DPRXA6NFQ7 191 aa18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 BMPR1BO00238 502 aa18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 SIAH2O43255 324 aa18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 CA2P00918 260 aa18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 IGFBP2P18065 325 aa18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 EDDM3AQ14507 147 aa18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 RPL39P5Q59GN2 51 aa18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 DCTN5Q9BTE1 182 aa18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 CACNA1HO95180 2353 aa18.75■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 HYPMO75409 117 aa18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 IGF2-ASQ6U949 168 aa18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 C11orf42Q8N5U0 333 aa18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 LRRC29Q8WV35 223 aa18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 PRR33A8MZF0 331 aa18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 SRIP30626 198 aa18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 HOXC12P31275 282 aa18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 LTC4SQ16873 150 aa18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 DMRTA1Q5VZB9 504 aa18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 OR4A47Q6IF82 309 aa18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 DOLPP1Q86YN1 238 aa18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 OR5B3Q8NH48 314 aa18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 BORCS7Q96B45 105 aa18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 TXN2Q99757 166 aa18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 PRNDQ9UKY0 176 aa18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 LYZL6O75951 148 aa18.73■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 TFF1P04155 84 aa18.73■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 C3orf79P0CE67 100 aa18.73■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 CFHR2P36980 270 aa18.73■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 MMDQ15546 238 aa18.73■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 NIT1Q86X76 327 aa18.73■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa18.73■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 SRRM5B3KS81 715 aa18.72■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 APCSP02743 223 aa18.72■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 SELENOVP59797 346 aa18.72■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 IGFL2Q6UWQ7 119 aa18.72■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF439Q8NDP4 499 aa18.72■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 RCHY1Q96PM5 261 aa18.72■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 FAM234AQ9H0X4 552 aa18.72■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa18.72■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC35D1Q9NTN3 355 aa18.72■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa18.72■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 IGLV2-8P01709 118 aa18.72■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 PMCHP20382 165 aa18.72■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF134P52741 427 aa18.72■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 Q6ZN92 141 aa18.72■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 PRSS33Q8NF86 280 aa18.72■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 TSKUQ8WUA8 353 aa18.72■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 PLEKHA3Q9HB20 300 aa18.72■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 IGHG3P01860 377 aa18.71■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 DEFB109BQ30KR1 87 aa18.71■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 FAM231DQ6ZW35 169 aa18.71■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 FAM214BQ7L5A3 538 aa18.71■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 GCSAMQ8N6F7 178 aa18.71■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF503Q96F45 646 aa18.71■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa18.71■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 DUSP13Q9UII6 198 aa18.71■□□□□ 0.59
ANKRD54-201ENST00000215941 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa18.7■□□□□ 0.58
ANKRD54-201ENST00000215941 CLCF1Q9UBD9 225 aa18.7■□□□□ 0.58
ANKRD54-201ENST00000215941 TRAV17A0A0B4J275 112 aa18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54-201ENST00000215941 GGTLC3B5MD39 225 aa18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54-201ENST00000215941 ACTL6BO94805 426 aa18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54-201ENST00000215941 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54-201ENST00000215941 PRCDQ00LT1 54 aa18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54-201ENST00000215941 CHRDL1Q9BU40 450 aa18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54-201ENST00000215941 CALYQ9NYX4 217 aa18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54-201ENST00000215941 OR51B2Q9Y5P1 312 aa18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54-201ENST00000215941 CGB3P0DN86 165 aa18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54-201ENST00000215941 CGB7P0DN87 165 aa18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54-201ENST00000215941 TFPI2P48307 235 aa18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54-201ENST00000215941 KIAA1644Q3SXP7 199 aa18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54-201ENST00000215941 STUMQ69YW2 141 aa18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54-201ENST00000215941 STPG4Q8N801 248 aa18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54-201ENST00000215941 OR7C2O60412 319 aa18.68■□□□□ 0.58
ANKRD54-201ENST00000215941 C8orf88P0DMB2 117 aa18.68■□□□□ 0.58
ANKRD54-201ENST00000215941 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
ANKRD54-201ENST00000215941 GUSBP1Q15486 140 aa18.68■□□□□ 0.58
ANKRD54-201ENST00000215941 C2orf83Q53S99 150 aa18.68■□□□□ 0.58
ANKRD54-201ENST00000215941 USF1P22415 310 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.4 ms