RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000634285.1

DMD-231, Transcript of dystrophin, human

Gene DMD, Length 671 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DMD-231	ENST00000634285	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	TMEM42	Q69YG0	159 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	DRAM2	Q6UX65	266 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	SSX8	Q7RTT4	187 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	LYG1	Q8N1E2	194 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	OR8U1	Q8NH10	309 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	UBALD1	Q8TB05	177 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	PIFO	Q8TCI5	191 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	AQP3	Q92482	292 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	VGLL1	Q99990	258 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	NICN1	Q9BSH3	213 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	ZNF580	Q9UK33	172 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285		V9GYS6	101 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285		A0A087WYN8	130 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	RFPL4A	A6NLU0	287 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	RFPL4AL1	F8VTS6	287 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285		H3BSA7	217 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	PIN1P1	O15428	100 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	ZNF737	O75373	536 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	IGHV3-7	P01780	117 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	CD24	P25063	80 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	BTC	P35070	178 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	HRH1	P35367	487 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	MNAT1	P51948	309 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	UBE2K	P61086	200 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	ZSCAN26	Q16670	478 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285		Q1RN00	199 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	MKX	Q8IYA7	352 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	PAXX	Q9BUH6	204 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	USE1	Q9NZ43	259 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285		R4GMQ9	66 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285		A0A0G2JMP0	313 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285		A0A0X1KG70	313 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	OR2AT4	A6NND4	320 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	TCF21	O43680	179 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	OXT	P01178	125 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	IFNG	P01579	166 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	IGKV3-20	P01619	116 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	HMGN1	P05114	100 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	HTR1A	P08908	422 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	PGA5	P0DJD9	388 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	FOLR2	P14207	255 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	CCL1	P22362	96 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	HSD11B1	P28845	292 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	IFNGR2	P38484	337 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	GABRA2	P47869	451 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	RGS6	P49758	472 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	RND2	P52198	227 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	APOC4	P55056	127 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	GNB2	P62879	340 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	CDK5R1	Q15078	307 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	LY6E	Q16553	131 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	TAL2	Q16559	108 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DMD-231	ENST00000634285	ZNF691	Q5VV52	312 aa		3.11	□□□□□ -1.91

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms