RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610468.4

MUC1-222, Transcript of mucin 1, cell surface associated, human

TSL 1 (best)

Gene MUC1, Length 1,162 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC1-222	ENST00000610468	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468		J3QRK9	145 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	DHFR	P00374	187 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	PPY	P01298	95 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	PMP2	P02689	132 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	HLA-DMA	P28067	261 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	FCGR2C	P31995	323 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	RCVRN	P35243	200 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	HRH1	P35367	487 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	ARL3	P36405	182 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	MSMO1	Q15800	293 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	TRIM63	Q969Q1	353 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	MLX	Q9UH92	298 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		10.4	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	CGB1	A6NKQ9	187 aa		10.4	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	IGHV3-23	P01764	117 aa		10.4	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	GNRHR	P30968	328 aa		10.4	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		10.4	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	OR4A47	Q6IF82	309 aa		10.4	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		10.4	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	MFSD4A	Q8N468	514 aa		10.4	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		10.4	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		10.4	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		10.4	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		10.4	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		10.39	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	10.39	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	HRAS	P01112	189 aa		10.39	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	CD3D	P04234	171 aa		10.39	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	C8orf88	P0DMB2	117 aa		10.39	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	HLA-G	P17693	338 aa		10.39	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		10.39	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		10.39	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		10.39	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	OR4A5	Q8NH83	315 aa		10.39	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	MARC2	Q969Z3	335 aa		10.39	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	MOB3A	Q96BX8	217 aa		10.39	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	CXorf58	Q96LI9	332 aa		10.39	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	GPHA2	Q96T91	129 aa		10.39	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	SRR	Q9GZT4	340 aa		10.39	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	IFT46	Q9NQC8	304 aa		10.39	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		10.39	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	BET1L	Q9NYM9	111 aa		10.39	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468		S4R3C0	116 aa		10.39	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		10.38	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF320	A2RRD8	509 aa		10.38	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	FABP12	A6NFH5	140 aa		10.38	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		10.38	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468		M0QYG6	137 aa		10.38	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	FGF2	P09038	288 aa		10.38	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	TAS2R46	P59540	309 aa		10.38	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	OR2B8P	P59922	312 aa		10.38	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	ARPC4	P59998	168 aa		10.38	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	POU2AF1	Q16633	256 aa		10.38	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		10.38	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	BTNL8	Q6UX41	500 aa		10.38	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		10.38	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		10.38	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		10.38	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		10.38	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	EHF	Q9NZC4	300 aa		10.38	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		10.38	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		10.37	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		10.37	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	CLEC3B	P05452	202 aa		10.37	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	MYOD1	P15172	320 aa		10.37	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	10.37	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	IL18	Q14116	193 aa		10.37	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	TM4SF20	Q53R12	229 aa		10.37	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		10.37	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		10.37	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		10.37	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		10.37	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		10.37	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		10.37	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	REG1A	P05451	166 aa		10.36	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	DEFA4	P12838	97 aa		10.36	□□□□□ -0.75

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