RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608657.5

ITGB5-212, Transcript of integrin subunit beta 5, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB5, Length 825 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5-212ENST00000608657 ODF3L1Q8IXM7 274 aa7.16□□□□□ -1.26
ITGB5-212ENST00000608657 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
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ITGB5-212ENST00000608657 LILRB2Q8N423 598 aa7.16□□□□□ -1.26
ITGB5-212ENST00000608657 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa7.16□□□□□ -1.26
ITGB5-212ENST00000608657 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa7.16□□□□□ -1.26
ITGB5-212ENST00000608657 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
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ITGB5-212ENST00000608657 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
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ITGB5-212ENST00000608657 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.271e-9■■□□□ 13.1
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ITGB5-212ENST00000608657 TNFRSF19Q9NS68 423 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGB5-212ENST00000608657 SVEP1Q4LDE5 3571 aa7.13□□□□□ -1.27
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