RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592533.5

ZNF540-210, Transcript of zinc finger protein 540, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene ZNF540, Length 3,147 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF540-210ENST00000592533 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa9.51□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 KIR2DL5AQ8N109 375 aa9.51□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 ENY2Q9NPA8 101 aa9.51□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa9.51□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 TM4SF5O14894 197 aa9.51□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 TMEM256Q8N2U0 113 aa9.51□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 C19orf24Q9BVV8 132 aa9.51□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 FKBP11Q9NYL4 201 aa9.51□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 OR51B2Q9Y5P1 312 aa9.51□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 C1orf194Q5T5A4 169 aa9.51□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 ITLN1Q8WWA0 313 aa9.51□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 TMEM167BQ9NRX6 74 aa9.51□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 UPK2O00526 184 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 OR4A8P0C604 315 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 IGFBP2P18065 325 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 WT1P19544 449 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 ZNF83P51522 516 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 IGF2-ASQ6U949 168 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 RNF7Q9UBF6 113 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 FOXH1O75593 365 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 IGHV3-7P01780 117 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 PAFAH1B2P68402 229 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 HLA-DRB5Q30154 266 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 C2orf83Q53S99 150 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 LEAP2Q969E1 77 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 GAFA1Q96PS6 74 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 V9GYV3 84 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 URB1O60287 2271 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 A8MXE2 369 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 NUPR1O60356 82 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 LINC00310P59036 64 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 RTL8BQ17RB0 113 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 MISP3Q96FF7 219 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 GCM1Q9NP62 436 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 IL19Q9UHD0 177 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 NAGKQ9UJ70 344 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 OR5G3P0C626 314 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 SELLP14151 372 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 OR10J1P30954 320 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 ZNF90Q03938 601 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 Q0VG73 95 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 OR4P4Q8NGL7 312 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 OR1L8Q8NGR8 309 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 CMTM2Q8TAZ6 248 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 PLEKHA3Q9HB20 300 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 BET1LQ9NYM9 111 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 DYSFO75923 2080 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 INS-IGF2F8WCM5 200 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 M0R1B8 84 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 ERVFC1-1P60608 527 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 RPEL1Q2QD12 228 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 PQLC2Q6ZP29 291 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 ZNF788Q6ZQV5 615 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 MIR17HGQ75NE6 70 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 LYG1Q8N1E2 194 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 J3QR06 171 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 SPRY3O43610 288 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 CT45A6P0DMU7 189 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 CT45A5P0DMU8 189 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 CT45A7P0DMV0 189 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 TEX36Q5VZQ5 186 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 OR5B3Q8NH48 314 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 ZNF503Q96F45 646 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 MS4A10Q96PG2 267 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 NABP2Q9BQ15 211 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 GNB1LQ9BYB4 327 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 BDP1A6H8Y1 2624 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 A0A1B0GUS0 222 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 OSTCQ9NRP0 149 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 CBLN1P23435 193 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 TPPP2P59282 170 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 RANP62826 216 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 COX19Q49B96 90 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 IGFL3Q6UXB1 125 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 MMD2Q8IY49 270 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 TMEM106BQ9NUM4 274 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 FAM215AQ9Y5M1 114 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 TNCP24821 2201 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 SLC17A3O00476 420 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 IGHV1-46P01743 117 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF540-210ENST00000592533 NDUFB7P17568 137 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms