RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 PPIAL4DF5H284 164 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 UPK2O00526 184 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 RRHO14718 337 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 NDUFB3O43676 98 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 PROP1O75360 226 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 CLN5O75503 358 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 STAG3L2P0CL84 134 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 STAG3L3P0CL85 134 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 PPIAL4FP0DN26 164 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 SELLP14151 372 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 RPL29P47914 159 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 NDUFA6P56556 154 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 B2MP61769 119 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 RPL23P62829 140 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 RPL31P62899 125 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 SPRNQ5BIV9 151 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 LRRC10Q5BKY1 277 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 CST9LP1Q5W188 147 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 TCF23Q7RTU1 214 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 C16orf82Q7Z2V1 217 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 DOLPP1Q86YN1 238 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 UHRF2Q96PU4 802 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 IMMP2LQ96T52 175 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 MGST2Q99735 147 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 SSX3Q99909 188 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 C19orf24Q9BVV8 132 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 SRD5A3Q9H8P0 318 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 DYNLRB1Q9NP97 96 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 JKAMPQ9P055 326 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 DOK5Q9P104 306 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 PPIAL4AQ9Y536 164 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A1W2PN81 502 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 J3QR06 171 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 CA2P00918 260 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 ARL14EPLP0DKL9 152 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 CHRNA7P36544 502 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 CASP6P55212 293 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC00205P59089 165 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 LCN2P80188 198 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 BSPH1Q075Z2 132 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 ADIPOQQ15848 244 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 MLANAQ16655 118 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 FBLN7Q53RD9 439 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 DNLZQ5SXM8 178 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM201AQ5SY85 155 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 SPNS3Q6ZMD2 512 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 PDPNQ86YL7 162 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 OR1L8Q8NGR8 309 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 LEAP2Q969E1 77 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 RNF2Q99496 336 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 PYGO2Q9BRQ0 406 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM167BQ9NRX6 74 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 C19orf73Q9NVV2 129 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC45A2Q9UMX9 530 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF835Q9Y2P0 537 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 SPTBN2O15020 2390 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 TRAV3A0A0B4J244 114 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-222ENST00000592408 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-222ENST00000592408 HIST1H2BKO60814 126 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-222ENST00000592408 YIF1AO95070 293 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-222ENST00000592408 IGHV3-7P01780 117 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-222ENST00000592408 TRGC2P03986 189 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-222ENST00000592408 HIST1H2BJP06899 126 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-222ENST00000592408 THBDP07204 575 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-222ENST00000592408 USF1P22415 310 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-222ENST00000592408 HIST1H2BOP23527 126 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-222ENST00000592408 GCHFRP30047 84 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-222ENST00000592408 HIST1H2BBP33778 126 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-222ENST00000592408 HIST1H2BDP58876 126 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-222ENST00000592408 TAS2R45P59539 299 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-222ENST00000592408 HIST1H2BCP62807 126 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-222ENST00000592408 CCL8P80075 99 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-222ENST00000592408 HIST2H2BEQ16778 126 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-222ENST00000592408 C2orf83Q53S99 150 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-222ENST00000592408 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-222ENST00000592408 MIC13Q5XKP0 118 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-222ENST00000592408 ABHD12Q8N2K0 398 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC00311Q8N616 119 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-222ENST00000592408 Q8N7P7 452 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-222ENST00000592408 STPG3Q8N7X2 389 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-222ENST00000592408 OR10X1Q8NGY0 326 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-222ENST00000592408 OR2T10Q8NGZ9 312 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-222ENST00000592408 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-222ENST00000592408 RND1Q92730 232 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-222ENST00000592408 NEUROG1Q92886 237 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-222ENST00000592408 HIST1H2BHQ93079 126 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM186Q96B77 213 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-222ENST00000592408 HARBI1Q96MB7 349 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-222ENST00000592408 HIST1H2BNQ99877 126 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-222ENST00000592408 HIST1H2BMQ99879 126 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-222ENST00000592408 PCGF1Q9BSM1 259 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-222ENST00000592408 HINT2Q9BX68 163 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-222ENST00000592408 COMMD5Q9GZQ3 224 aa7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.6 ms