RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589232.5

GTF3C2-AS1-206, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 254 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CFHR2P36980 270 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RPL35P42766 123 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 GLP1RP43220 463 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 GPM6AP51674 278 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 UCP3P55916 312 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CD81P60033 236 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 GNG3P63215 75 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 IL13RA2Q14627 380 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PIGYQ3MUY2 71 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DNLZQ5SXM8 178 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DHRS11Q6UWP2 260 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 GSG1LQ6UXU4 331 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 Q6ZR03 302 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TMUB2Q71RG4 321 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TMEM144Q7Z5S9 345 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MKXQ8IYA7 352 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 Q8IYB0 196 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 FGFRL1Q8N441 504 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PNKDQ8N490 385 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 KCNRGQ8N5I3 272 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TMEM86BQ8N661 226 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 OR4A16Q8NH70 328 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CASTOR1Q8WTX7 329 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SSMEM1Q8WWF3 244 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TMEM230Q96A57 120 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PTH2Q96A98 100 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 GALNT14Q96FL9 552 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TIMD4Q96H15 378 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SULT4A1Q9BR01 284 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ATG101Q9BSB4 218 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 FAAP24Q9BTP7 215 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 NMES1Q9C002 83 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ARL6Q9H0F7 186 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ZNF286AQ9HBT8 521 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SIRT7Q9NRC8 400 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MED9Q9NWA0 146 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 COMMD9Q9P000 198 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MIOXQ9UGB7 285 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 KIF25Q9UIL4 384 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TNFSF18Q9UNG2 199 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 A0A1B0GW55 424 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RNF222A6NCQ9 220 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CGB1A6NKQ9 187 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 OR11H12B2RN74 326 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ZNF732B4DXR9 585 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 H0Y980 276 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 NBR2O15453 112 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 BCL2L11O43521 198 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CFDP00746 253 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 IGHV1-69P01742 117 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 IGHV3-13P01766 116 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 GRPP07492 148 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DUX4L2P0CJ85 424 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DUX4L3P0CJ86 424 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DUX4L4P0CJ87 422 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DUX4L5P0CJ88 424 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DUX4L6P0CJ89 424 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DUX4L7P0CJ90 424 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ZNF728P0DKX0 622 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PPIAL4GP0DN37 164 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 LYL1P12980 280 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PGAM2P15259 253 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 BCL3P20749 454 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 GNRHRP30968 328 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 KIR2DS4P43632 304 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 HERV-K104P61576 105 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PPP1CBP62140 327 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SRPXP78539 464 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PJVKQ0ZLH3 352 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 KIR2DS1Q14954 304 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TNXAQ16473 311 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 OR2B11Q5JQS5 317 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 OR8G2PQ6IF36 304 aa3.23□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms