RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 RASL11BQ9BPW5 248 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 PRDM13Q9H4Q3 707 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 RAB18Q9NP72 206 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 C19orf73Q9NVV2 129 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM160Q9NX00 188 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 BET1LQ9NYM9 111 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 OR5AC2Q9NZP5 309 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 KIAA1456Q9P272 454 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 MOB4Q9Y3A3 225 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 OR51B2Q9Y5P1 312 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 WSB1Q9Y6I7 421 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 S4R3C0 116 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 ACANP16112 2415 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 BTBD17A6NE02 478 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 MSGN1A6NI15 193 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 CEBPZOSA8MTT3 80 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 TEX22C9J3V5 150 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 K7EPK0 472 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 WRBO00258 174 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 CNIH1O95406 144 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM50AO95807 157 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 IFNA17P01571 189 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM157CP0CG43 387 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 AREGP15514 252 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 HLA-GP17693 338 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 LGALS7P47929 136 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 RPL8P62917 257 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 UBA52P62987 128 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 CX3CL1P78423 397 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 IL15RAQ13261 267 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 FXYD3Q14802 87 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 TEX45Q8NA69 505 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 OR5T1Q8NG75 326 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 SSMEM1Q8WWF3 244 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 OR4C12Q96R67 309 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 NEURL2Q9BR09 285 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF702PQ9H963 129 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 TMED3Q9Y3Q3 217 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 CSPG4Q6UVK1 2322 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1B0GU03 582 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM24AA6NFZ4 105 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 B3GALNT1O75752 331 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 SPDEFO95238 335 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 IGHV3-48P01763 117 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 OR13C7P0DN81 318 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 COMPP49747 757 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 MFAP2P55001 183 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 PAX9P55771 341 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 HILS1P60008 231 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 WT1-ASQ06250 92 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 TNFRSF9Q07011 255 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 AANATQ16613 207 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 Q6ZSV7 163 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC35E3Q7Z769 313 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 MMD2Q8IY49 270 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 TEX29Q8N6K0 151 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 LFNGQ8NES3 379 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 OR11H4Q8NGC9 324 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 OR2T35Q8NGX2 323 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 OR5R1Q8NH85 324 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM170AQ8WVE7 144 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 ARPC1AQ92747 370 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 RNF126Q9BV68 326 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 COMMD5Q9GZQ3 224 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 C11orf1Q9H5F2 150 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM14BQ9NUH8 114 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 C1RLQ9NZP8 487 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 MBD2Q9UBB5 411 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 CSMD1Q96PZ7 3565 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 PLXNB1O43157 2135 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 IGLC7A0M8Q6 106 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 IGSF23A1L1A6 192 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 SYNGR2O43760 224 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 SOX15O60248 233 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 ATG12O94817 140 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 MPC2O95563 127 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 IGHV3-23P01764 117 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 HLA-DRB1P01911 266 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 GIPP09681 153 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
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