RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 SLC25A38Q96DW6 304 aa5.93□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 RAB3CQ96E17 227 aa5.93□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 OR4F4Q96R69 305 aa5.93□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 DCSTAMPQ9H295 470 aa5.93□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 NECAP2Q9NVZ3 263 aa5.93□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 VPREB3Q9UKI3 123 aa5.93□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 SACSQ9NZJ4 4579 aa5.92□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa5.92□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 MFNGO00587 321 aa5.92□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 CHST1O43916 411 aa5.92□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 CD24P25063 80 aa5.92□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 HTR1DP28221 377 aa5.92□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 ERVK-16P61578 105 aa5.92□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 CYCSP99999 105 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 PJVKQ0ZLH3 352 aa5.92□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 HERPUD1Q15011 391 aa5.92□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 HMGN3Q15651 99 aa5.92□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 CNPY1Q3B7I2 92 aa5.92□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa5.92□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 MINOS1Q5TGZ0 78 aa5.92□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF880Q6PDB4 577 aa5.92□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF439Q8NDP4 499 aa5.92□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 OR10A7Q8NGE5 316 aa5.92□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 OR10X1Q8NGY0 326 aa5.92□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF596Q8TC21 504 aa5.92□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 PIFOQ8TCI5 191 aa5.92□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa5.92□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 IL1F10Q8WWZ1 152 aa5.92□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 ACOT12Q8WYK0 555 aa5.92□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 AP3S1Q92572 193 aa5.92□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 PTX4Q96A99 478 aa5.92□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 SLC25A46Q96AG3 418 aa5.92□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 MALSU1Q96EH3 234 aa5.92□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 C12orf4Q9NQ89 552 aa5.92□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 RHBDL2Q9NX52 303 aa5.92□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 KCNIP1Q9NZI2 227 aa5.92□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 DPM3Q9P2X0 92 aa5.92□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 GNG12Q9UBI6 72 aa5.92□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa5.92□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa5.91□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 METTL21EPA6NDL7 271 aa5.91□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM235A6NFC5 223 aa5.91□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 LEUTXA8MZ59 168 aa5.91□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 LY6LH3BQJ8 138 aa5.91□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 FCGR3AP08637 254 aa5.91□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 SCTP09683 121 aa5.91□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 CD3GP09693 182 aa5.91□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 REG1BP48304 166 aa5.91□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 PPT1P50897 306 aa5.91□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 RORCP51449 518 aa5.91□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 PRRX1P54821 245 aa5.91□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 HLA-DRB3P79483 266 aa5.91□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 SPCS2Q15005 226 aa5.91□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 ECSCRQ19T08 205 aa5.91□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 CDNFQ49AH0 187 aa5.91□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 TOMM40LQ969M1 308 aa5.91□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 SDF2L1Q9HCN8 221 aa5.91□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 OR2S2Q9NQN1 319 aa5.91□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 ABCB10Q9NRK6 738 aa5.91□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 ABRACLQ9P1F3 81 aa5.91□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 OR1A1Q9P1Q5 309 aa5.91□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 RYR2Q92736 4967 aa5.91□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa5.9□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa5.9□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa5.9□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa5.9□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 A6NDX4 124 aa5.9□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 SERPINE3A8MV23 424 aa5.9□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 VGLL3A8MV65 326 aa5.9□□□□□ -1.46
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ATG4D-210ENST00000588972 CEACAM3P40198 252 aa5.9□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
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ATG4D-210ENST00000588972 ARFRP1Q13795 201 aa5.9□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF876PQ49A33 203 aa5.9□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 MORN2Q502X0 79 aa5.9□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 CT45A1Q5HYN5 189 aa5.9□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 UBE2NLQ5JXB2 153 aa5.9□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 MOB1BQ7L9L4 216 aa5.9□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 LINC00311Q8N616 119 aa5.9□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 SAMD12Q8N8I0 201 aa5.9□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 OR56B4Q8NH76 319 aa5.9□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 CT45A3Q8NHU0 189 aa5.9□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 C11orf45Q8TAV5 145 aa5.9□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 RPEQ96AT9 228 aa5.9□□□□□ -1.46
ATG4D-210ENST00000588972 AKR1E2Q96JD6 320 aa5.9□□□□□ -1.46
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