RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 ZNF665Q9H7R5 613 aa6.61□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 RPRMQ9NS64 109 aa6.61□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.61□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 A0A0G2JRQ6 117 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 C9JQL5 133 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 G3V4G9 280 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 FSTL3O95633 263 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 CD1BP29016 333 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 SRP14P37108 136 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 FABP6P51161 128 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 LCN2P80188 198 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 FOXL1Q12952 345 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 HAGHQ16775 308 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 TMEM241Q24JQ0 296 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 MORN2Q502X0 79 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 TEX36Q5VZQ5 186 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 NCR3LG1Q68D85 454 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 VWA1Q6PCB0 445 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 Q6ZRM9 215 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 ZNF610Q8N9Z0 462 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 OR10G9Q8NGN4 311 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 OR10G7Q8NGN6 311 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 OR5B3Q8NH48 314 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 OR4A5Q8NH83 315 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 OR4C12Q96R67 309 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 RNF2Q99496 336 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 NPCDR1Q9BY65 106 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 ESM1Q9NQ30 184 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 CALYQ9NYX4 217 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 CLN8Q9UBY8 286 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 WDR83OSQ9Y284 106 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 A0A1W2PPH5 198 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 A0A1W2PPV4 95 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 C15orf61A6NNL5 157 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 ZNF727A8MUV8 499 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 INS-IGF2F8WCM5 200 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 H3BP45 60 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 CLN5O75503 358 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 S1PR2O95136 353 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 IAPPP10997 89 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 DAOP14920 347 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 MDKP21741 143 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 FGF7P21781 194 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 S100A2P29034 98 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 CCKARP32238 428 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 G6PCP35575 357 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 ERVS71-1P61550 626 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 RUNX1Q01196 453 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 HNF4GQ14541 408 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 Q6ZR03 302 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 ODF3L1Q8IXM7 274 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 BATF2Q8N1L9 274 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 PNKDQ8N490 385 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 OR13A1Q8NGR1 328 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 TNFRSF14Q92956 283 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 SLC35E1Q96K37 410 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 OR2V2Q96R30 315 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 C12orf57Q99622 126 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 SMIM7Q9BQ49 75 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 NPVFQ9HCQ7 196 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 GFOD1Q9NXC2 390 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 DOK5Q9P104 306 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 PSG11Q9UQ72 335 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 LINC00312Q9Y6C7 94 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 LY96Q9Y6Y9 160 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 NCKAP5O14513 1909 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-218ENST00000584243 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-218ENST00000584243 ZFP92A6NM28 416 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-218ENST00000584243 C16orf97H3BN30 126 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-218ENST00000584243 M0R1B8 84 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-218ENST00000584243 M0R1X1 148 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-218ENST00000584243 SIGLEC5O15389 551 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-218ENST00000584243 CXorf1O96002 111 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-218ENST00000584243 IFNA10P01566 189 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-218ENST00000584243 IGHV2-5P01817 119 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-218ENST00000584243 APOA2P02652 100 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-218ENST00000584243 IL3RAP26951 378 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-218ENST00000584243 SSTR5P35346 364 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-218ENST00000584243 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
GGA3-218ENST00000584243 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
GGA3-218ENST00000584243 FOXF2Q12947 444 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-218ENST00000584243 COX19Q49B96 90 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-218ENST00000584243 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-218ENST00000584243 FAM90A2PQ658T7 463 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-218ENST00000584243 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa6.58□□□□□ -1.36
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