RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 KDM3BQ7LBC6 1761 aa2.45□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa2.45□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 ITGB4P16144 1822 aa2.45□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 PREX1Q8TCU6 1659 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 NUP205Q92621 2012 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 TECPR2O15040 1411 aa2.44□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 CPS1P31327 1500 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa2.44□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 MYO3AQ8NEV4 1616 aa2.44□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 A0A0G2JK05 382 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM250H0YL14 139 aa2.44□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 ISLRO14498 428 aa2.44□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 LYZL6O75951 148 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 UBL3O95164 117 aa2.44□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 HLA-DRB1P01911 266 aa2.44□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 PGA5P0DJD9 388 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 CTLA4P16410 223 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 GADD45AP24522 165 aa2.44□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 RND2P52198 227 aa2.44□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 LIM2P55344 173 aa2.44□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 HERVK_113P63121 156 aa2.44□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 DUSP5Q16690 384 aa2.44□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 PAGE3Q5JUK9 113 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF506Q5JVG8 444 aa2.44□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 SLC25A45Q8N413 288 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 C10orf126Q8N4M7 172 aa2.44□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 OR10J6PQ8NGY7 276 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 OR4K13Q8NH42 304 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 OR4A5Q8NH83 315 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 OR2T6Q8NHC8 308 aa2.44□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 NEUROG1Q92886 237 aa2.44□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 DPH3Q96FX2 82 aa2.44□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 C2orf48Q96LS8 159 aa2.44□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 PARLQ9H300 379 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 ST20Q9HBF5 79 aa2.44□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 CACNG5Q9UF02 275 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 OR5V1Q9UGF6 321 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 WASHC3Q9Y3C0 194 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 LINC00312Q9Y6C7 94 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 SMCHD1A6NHR9 2005 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 DOCK6Q96HP0 2047 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
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