RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577256.5

ATG13-223, Transcript of autophagy related 13, human

TSL 4

Gene ATG13, Length 613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG13-223	ENST00000577256	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-223	ENST00000577256	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-223	ENST00000577256	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-223	ENST00000577256	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-223	ENST00000577256	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-223	ENST00000577256	REG1A	P05451	166 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-223	ENST00000577256	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-223	ENST00000577256	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-223	ENST00000577256	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-223	ENST00000577256	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-223	ENST00000577256	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-223	ENST00000577256	OR5B3	Q8NH48	314 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-223	ENST00000577256	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-223	ENST00000577256	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-223	ENST00000577256	PRRT1	Q99946	306 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-223	ENST00000577256	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-223	ENST00000577256	SORL1	Q92673	2214 aa		13.52	□□□□□ -0.24
ATG13-223	ENST00000577256	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	C15orf61	A6NNL5	157 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	CYB5B	O43169	146 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	B3GALNT1	O75752	331 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	IGKV1-39	P01597	117 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	TRBV12-3	P01733	135 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	IGKV1D-39	P04432	117 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	TATDN3	Q17R31	274 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	RPEL1	Q2QD12	228 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	OR4C12	Q96R67	309 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	NSG2	Q9Y328	171 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	ATG12	O94817	140 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	PYDC2	Q56P42	97 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	OR4A16	Q8NH70	328 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	TMEM56	Q96MV1	263 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	TP53RK	Q96S44	253 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	HINT2	Q9BX68	163 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	THYN1	Q9P016	225 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	BMPR1B	O00238	502 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	NDUFB8	O95169	186 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	OR13C7	P0DN81	318 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	SYNJ2BP	P57105	145 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256		V9GYH0	126 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	UCP1	P25874	307 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	AKR1C2	P52895	323 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	AP3S2	P59780	193 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	WT1-AS	Q06250	92 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	TRIM16L	Q309B1	348 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	CCDC190	Q86UF4	302 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256		Q8N402	240 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	CXorf58	Q96LI9	332 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	GPR132	Q9UNW8	380 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		13.48	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	DBX1	A6NMT0	343 aa		13.48	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	SP6	Q3SY56	376 aa		13.48	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		13.48	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	TRIM63	Q969Q1	353 aa		13.48	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	PRR25	Q96S07	402 aa		13.48	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	MCUB	Q9NWR8	336 aa		13.48	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	PEMT	Q9UBM1	199 aa		13.48	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	LY86	O95711	162 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	IGKV1-5	P01602	117 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	ETV6	P41212	452 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF79	Q15937	498 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	CCDC140	Q96MF4	163 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	NAA60	Q9H7X0	242 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	PPP5D1	E7EU14	171 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	IGHV3-23	P01764	117 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	OR5AC1	P0C628	307 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256		P0C879	139 aa		13.46	□□□□□ -0.25

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