RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568631.5

RNPS1-223, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RNPS1, Length 1,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-223	ENST00000568631	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		12.87	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		12.87	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		12.87	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631		A0A0D9SG52	128 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	RNF222	A6NCQ9	220 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	FGF16	O43320	207 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	CNIH1	O95406	144 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	CXCL2	P19875	107 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	SCGB2A2	Q13296	93 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	LY6E	Q16553	131 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	HSPB11	Q9Y547	144 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631		M0QZK8	103 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	AKAP9	Q99996	3911 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	MSGN1	A6NI15	193 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631		E7EUB6	86 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631		H3BP45	60 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	IGHV4-59	P01825	116 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	HLA-DRB1	P01911	266 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	C4BPB	P20851	252 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	FXYD3	Q14802	87 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631		U3KQ87	197 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	CGB1	A6NKQ9	187 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	CX3CL1	P78423	397 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	STX12	Q86Y82	276 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	IGSF23	A1L1A6	192 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	IFNA10	P01566	189 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	12.84	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	BAX	Q07812	192 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	TMUB2	Q71RG4	321 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631	ARL6	Q9H0F7	186 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RNPS1-223	ENST00000568631		A0A1B0GW64	132 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	S100A11	P31949	105 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	HTR2B	P41595	481 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	SULT1A1	P50225	295 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	ARPC1A	Q92747	370 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	OR4C12	Q96R67	309 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	SNCA	P37840	140 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	WT1-AS	Q06250	92 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	ZAN	Q9Y493	2812 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	TEX22	C9J3V5	150 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	AMY1A	P04745	511 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	OR13C7	P0DN81	318 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	NPY1R	P25929	384 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	RAB11A	P62491	216 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	NHLH2	Q02577	135 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	TMEM86B	Q8N661	226 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	TNC	P24821	2201 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	C15orf62	A8K5M9	175 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	TAAR5	O14804	337 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	CST7	O76096	145 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	OR8U8	P0C7N1	319 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	SRD5A1	P18405	259 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	OPCML	Q14982	345 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	BSX	Q3C1V8	233 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-223	ENST00000568631	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		12.81	□□□□□ -0.36

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