RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558936.5

RABGGTA-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTA, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-207ENST00000558936 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTA-207ENST00000558936 PPP5D1E7EU14 171 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTA-207ENST00000558936 OVOL1O14753 267 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTA-207ENST00000558936 ACTL6BO94805 426 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTA-207ENST00000558936 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
RABGGTA-207ENST00000558936 MECP2P51608 486 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
RABGGTA-207ENST00000558936 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
RABGGTA-207ENST00000558936 CD300LFQ8TDQ1 290 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTA-207ENST00000558936 BORCS5Q969J3 196 aa9.64□□□□□ -0.87
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RABGGTA-207ENST00000558936 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
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RABGGTA-207ENST00000558936 H0Y980 276 aa9.63□□□□□ -0.87
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RABGGTA-207ENST00000558936 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTA-207ENST00000558936 CMTM1Q8IZ96 169 aa9.63□□□□□ -0.87
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RABGGTA-207ENST00000558936 PRR25Q96S07 402 aa9.63□□□□□ -0.87
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RABGGTA-207ENST00000558936 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
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RABGGTA-207ENST00000558936 C15orf61A6NNL5 157 aa9.62□□□□□ -0.87
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RABGGTA-207ENST00000558936 OR5AC1P0C628 307 aa9.62□□□□□ -0.87
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RABGGTA-207ENST00000558936 INSL3P51460 131 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTA-207ENST00000558936 LPCAT3Q6P1A2 487 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTA-207ENST00000558936 GDPD1Q8N9F7 314 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTA-207ENST00000558936 C15orf40Q8WUR7 153 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGGTA-207ENST00000558936 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGGTA-207ENST00000558936 FBXL7Q9UJT9 491 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTA-207ENST00000558936 IZUMO1RA6ND01 250 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTA-207ENST00000558936 A6NHS1 94 aa9.61□□□□□ -0.87
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RABGGTA-207ENST00000558936 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa9.6□□□□□ -0.87
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RABGGTA-207ENST00000558936 SAP30O75446 220 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTA-207ENST00000558936 TRAPPC2P0DI81 140 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTA-207ENST00000558936 TRAPPC2BP0DI82 140 aa9.6□□□□□ -0.87
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RABGGTA-207ENST00000558936 SPNP16150 400 aa9.6□□□□□ -0.87
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RABGGTA-207ENST00000558936 TMEM187Q14656 261 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTA-207ENST00000558936 MEF2DQ14814 521 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTA-207ENST00000558936 AARDQ4LEZ3 155 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTA-207ENST00000558936 PVRIGQ6DKI7 326 aa9.6□□□□□ -0.87
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RABGGTA-207ENST00000558936 Q8N1Y9 231 aa9.6□□□□□ -0.87
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RABGGTA-207ENST00000558936 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa9.6□□□□□ -0.87
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RABGGTA-207ENST00000558936 OR2C1O95371 312 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-207ENST00000558936 IGLV1-51P01701 117 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-207ENST00000558936 ZP3P21754 424 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-207ENST00000558936 ADMP35318 185 aa9.59□□□□□ -0.87
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RABGGTA-207ENST00000558936 CLEC19AQ6UXS0 136 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-207ENST00000558936 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-207ENST00000558936 OR2C3Q8N628 320 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-207ENST00000558936 OR1L8Q8NGR8 309 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-207ENST00000558936 GPR146Q96CH1 333 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-207ENST00000558936 TMEM56Q96MV1 263 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-207ENST00000558936 COMMD5Q9GZQ3 224 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-207ENST00000558936 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-207ENST00000558936 RABL2BQ9UNT1 228 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
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