RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 LGALS4P56470 323 aa8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 PRSS57Q6UWY2 283 aa8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 SRIP30626 198 aa8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 TBC1D28Q2M2D7 210 aa8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 OR8I2Q8N0Y5 310 aa8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 FAM58AQ8N1B3 248 aa8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 GJC3Q8NFK1 279 aa8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 RNF138Q8WVD3 245 aa8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 DYNLRB1Q9NP97 96 aa8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 IL36GQ9NZH8 169 aa8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa8.4□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 A0A0G2JNJ9 132 aa8.4□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 SCO2A0A1W2PP80 73 aa8.4□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 EBLN2Q6P2I7 272 aa8.4□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 KIR3DL3Q8N743 410 aa8.4□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 IL36BQ9NZH7 164 aa8.4□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 CRIM1Q9NZV1 1036 aa8.4□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 CLCF1Q9UBD9 225 aa8.4□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 Q9UFV3 132 aa8.4□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 NDUFS8O00217 210 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 CD3EP07766 207 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 PLCXD3Q63HM9 321 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 FAM71F2Q6NXP2 309 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 OSR2Q8N2R0 312 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 DEFB125Q8N687 156 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 RDH5Q92781 318 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 ROS1P08922 2347 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 C22orf46C9J442 243 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 H0Y980 276 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 H0YJW9 148 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 TOX4O94842 621 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 F2RP25116 425 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 FAM27E3Q08E93 113 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 FOXF2Q12947 444 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 BORCS7Q96B45 105 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 G3V4G9 280 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 OR7C2O60412 319 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 PDCD6O75340 191 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 IGKV1-5P01602 117 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 SERPINE2P07093 398 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 PPIAL4GP0DN37 164 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 Q6ZT83 130 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 OR1B1Q8NGR6 318 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM186Q96B77 213 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 C17orf112F2Z3M2 114 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 PAX2Q02962 417 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF841Q6ZN19 808 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 RPRMLQ8N4K4 120 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 OR4S2Q8NH73 311 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 DUSP13Q9UII6 198 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 FOXE3Q13461 319 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 MMD2Q8IY49 270 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 LINC01560Q8TB33 94 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 DOCK7Q96N67 2140 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 BMPR1BO00238 502 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 PDE6DO43924 150 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 IGLC1P0CG04 106 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 SSTR5P35346 364 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 TCL1AP56279 114 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 OR4P4Q8NGL7 312 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM45BQ96B21 275 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 PKDREJQ9NTG1 2253 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 CD300LBA8K4G0 201 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 GRB2P62993 217 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 SAMD13Q5VXD3 122 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF462Q96JM2 2506 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 ABCA4P78363 2273 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 CLDN1O95832 211 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 OR10P1Q8NGE3 313 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 HS3ST6Q96QI5 342 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 FAM215AQ9Y5M1 114 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 WISP2O76076 250 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 OR10J3Q5JRS4 329 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 PRR31Q5SQ13 230 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 C5orf17Q8NAS9 161 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 hDV102S1A0JD36 115 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 COX5AP20674 150 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 HTD2P86397 168 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 PMCHL1Q16048 86 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 TNXAQ16473 311 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 ASPHD1Q5U4P2 390 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM136Q6ZRR5 245 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-211ENST00000520276 NPCDR1Q9BY65 106 aa8.37□□□□□ -1.07
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