RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 LMO1P25800 156 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 SSTR5P35346 364 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 TAS2R30P59541 319 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM41BQ5BJD5 291 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 IGFL3Q6UXB1 125 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF66Q6ZN08 573 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 Q6ZSR3 168 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 C5orf17Q8NAS9 161 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 ZNRF1Q8ND25 227 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 RAX2Q96IS3 184 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM106BQ9NUM4 274 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 FAM215AQ9Y5M1 114 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 PSPNO60542 156 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 COX5AP20674 150 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 F2RP25116 425 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 GLRXP35754 106 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 ID4P47928 161 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 TMPRSS3P57727 454 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM187Q14656 261 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 LRRC10Q5BKY1 277 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 WDR86Q86TI4 376 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 DOLPP1Q86YN1 238 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 PNKDQ8N490 385 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 SCGB1C1Q8TD33 95 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 DCTN5Q9BTE1 182 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM222Q9H0R3 208 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 CACNG5Q9UF02 275 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 JPT1Q9UK76 154 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 LRRC30A6NM36 301 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 TMPRSS2O15393 492 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 YPEL1O60688 119 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 NAPSAO96009 420 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 HBZP02008 142 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 SMIM17P0DL12 118 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 SPANXN5Q5MJ07 72 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 POC1AQ8NBT0 407 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 ABHD14BQ96IU4 210 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 YPEL2Q96QA6 119 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 RNF126Q9BV68 326 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 SLC25A15Q9Y619 301 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 ASPMQ8IZT6 3477 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 CEBPZOSA8MTT3 80 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 CEACAM4O75871 244 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 RPS16P62249 146 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 TBR1Q16650 682 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 C5orf47Q569G3 176 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF429Q86V71 674 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 OR2C3Q8N628 320 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 KLHDC1Q8N7A1 406 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF709Q8N972 641 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 FAM213BQ8TBF2 198 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM170AQ8WVE7 144 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 CABLES2Q9BTV7 478 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 OOEPA6NGQ2 149 aa6.55□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 CHST1O43916 411 aa6.55□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 CD40P25942 277 aa6.55□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 MSMO1Q15800 293 aa6.55□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 ACP7Q6ZNF0 438 aa6.55□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 OR10X1Q8NGY0 326 aa6.55□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 ANAPC10Q9UM13 185 aa6.55□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 CCL21O00585 134 aa6.55□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 SNAI2O43623 268 aa6.55□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 GPR137BO60478 399 aa6.55□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 TNFRSF1AP19438 455 aa6.55□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.55□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 SEM1Q6ZVN7 128 aa6.55□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 OR5B3Q8NH48 314 aa6.55□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.55□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 PSG8Q9UQ74 426 aa6.55□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 CEACAM18A8MTB9 384 aa6.55□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 C12orf77C9JDV5 145 aa6.55□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 H7BYZ3 331 aa6.55□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 M0R1X1 148 aa6.55□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 RAB29O14966 203 aa6.55□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 DEDDO75618 318 aa6.55□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 ERVK-16P61578 105 aa6.55□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 TLE1Q04724 770 aa6.55□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF266Q14584 549 aa6.55□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.55□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa6.55□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa6.55□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.55□□□□□ -1.36
TRPS1-208ENST00000519076 OR5C1Q8NGR4 320 aa6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms