RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515835.2

PDE4D-225, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PDE4D, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-225ENST00000515835 ACTBP60709 375 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-225ENST00000515835 QRFPP83859 136 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-225ENST00000515835 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-225ENST00000515835 TPBGQ13641 420 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-225ENST00000515835 GNMTQ14749 295 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-225ENST00000515835 HSD17B12Q53GQ0 312 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-225ENST00000515835 PYHIN1Q6K0P9 492 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-225ENST00000515835 C6orf201Q7Z4U5 140 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-225ENST00000515835 MINDY2Q8NBR6 621 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-225ENST00000515835 C11orf52Q96A22 123 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-225ENST00000515835 PTX4Q96A99 478 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-225ENST00000515835 SULT4A1Q9BR01 284 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-225ENST00000515835 FAAP24Q9BTP7 215 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-225ENST00000515835 ANKRD60Q9BZ19 345 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-225ENST00000515835 IFI27L2Q9H2X8 130 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-225ENST00000515835 OR51J1Q9H342 316 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-225ENST00000515835 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-225ENST00000515835 TPRKBQ9Y3C4 175 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-225ENST00000515835 COL7A1Q02388 2944 aa4.59□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 TENM3Q9P273 2699 aa4.59□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 SEC14L6B5MCN3 397 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 SLC17A2O00624 439 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 DIRAS3O95661 229 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 ZBTB25P24278 435 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 SERPINB10P48595 397 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 RAB9AP51151 201 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 RAB25P57735 213 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF616Q08AN1 781 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 UNC119Q13432 240 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF562Q6V9R5 426 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 CEACAM19Q7Z692 300 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF429Q86V71 674 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF491Q8N8L2 437 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 OR11H1Q8NG94 326 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 OR1N2Q8NGR9 330 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 IL1F10Q8WWZ1 152 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 UFD1Q92890 307 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 FAM46BQ96A09 425 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 SOSTQ9BQB4 213 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 AGMATQ9BSE5 352 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 TMED9Q9BVK6 235 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 LPAR5Q9H1C0 372 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 DUSP21Q9H596 190 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 SRD5A3Q9H8P0 318 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 C12orf4Q9NQ89 552 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 WASHC3Q9Y3C0 194 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 NOTCH3Q9UM47 2321 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 H0YJW9 148 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 BRI3O95415 125 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 CT45A6P0DMU7 189 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 CT45A5P0DMU8 189 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 CT45A7P0DMV0 189 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 CD40LGP29965 261 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 CEACAM6P40199 344 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 DSCR10P59022 87 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 HLA-DRB3P79483 266 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 INSL4Q14641 139 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 DEFB136Q30KP8 78 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 AKIRIN2Q53H80 203 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 FAM27D1Q5T7N8 215 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 OR10K2Q6IF99 312 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 FAM131AQ6UXB0 335 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 TMEM91Q6ZNR0 172 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 PDPNQ86YL7 162 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 OR56B1Q8NGI3 324 aa4.57□□□□□ -1.68
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PDE4D-225ENST00000515835 CHCHD5Q9BSY4 110 aa4.57□□□□□ -1.68
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PDE4D-225ENST00000515835 PLGRKTQ9HBL7 147 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 ACOT13Q9NPJ3 140 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 PARP11Q9NR21 331 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 WSB1Q9Y6I7 421 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 G3V318 75 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 H3BUA1 57 aa4.56□□□□□ -1.68
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PDE4D-225ENST00000515835 OVOL1O14753 267 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 SOCS1O15524 211 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 SOX15O60248 233 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 CLN5O75503 358 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 GALP22466 123 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 CNTFRP26992 372 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 FCGR2CP31995 323 aa4.56□□□□□ -1.68
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