RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP1.56□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP1.56□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 C6orf99Q4VX62 202 aa1.56□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 C14orf177Q52M58 125 aa1.56□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 GLYATQ6IB77 296 aa1.56□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 PLET1Q6UQ28 207 aa1.56□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa1.56□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 GTSCR1Q86UQ5 136 aa1.56□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 BAP18Q8IXM2 172 aa1.56□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF615Q8N8J6 731 aa1.56□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 C15orf56Q8N910 161 aa1.56□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 OR4M1Q8NGD0 313 aa1.56□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 OR2K2Q8NGT1 345 aa1.56□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 TYMSOSQ8TAI1 123 aa1.56□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 ROPN1LQ96C74 230 aa1.56□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 ACY3Q96HD9 319 aa1.56□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 OR4K3Q96R72 315 aa1.56□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF649Q9BS31 505 aa1.56□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC32Q9BV29 185 aa1.56□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa1.56□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 PARP11Q9NR21 331 aa1.56□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa1.56□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 SPAG17Q6Q759 2223 aa1.56□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 CHD5Q8TDI0 1954 aa1.56□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 A0A1B0GXF2 115 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 FAM159BA6NKW6 160 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM250H0YL14 139 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 ENSAO43768 121 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 SCO1O75880 301 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 CDRT1O95170 752 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 MOSP00540 346 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 PRB1P04280 392 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 C8GP07360 202 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 MPC1LP0DKB6 136 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 SMIM17P0DL12 118 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 EVI2AP22794 236 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 PYCR1P32322 319 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 CD200P41217 278 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 PFN3P60673 137 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 PPP3R1P63098 170 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF404Q494X3 552 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 LCE1FQ5T754 118 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 Q6ZTC4 211 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 MUC15Q8N387 334 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 OR4C13Q8NGP0 309 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 OR1L8Q8NGR8 309 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 C15orf40Q8WUR7 153 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 STARD4Q96DR4 205 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 SMIM8Q96KF7 97 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 FOPNLQ96NB1 174 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 OR2A5Q96R48 311 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM243Q9BU79 118 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 PBOV1Q9GZY1 135 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 VSIRQ9H7M9 311 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 TNFRSF19Q9NS68 423 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 OPTCQ9UBM4 332 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 NUP205Q92621 2012 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 TEX15Q9BXT5 2789 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 SPTA1P02549 2419 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 A0A1B0GVG6 124 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 TRIM49D1C9J1S8 452 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 CA2P00918 260 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 HBZP02008 142 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 TRAPPC2P0DI81 140 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 TRAPPC2BP0DI82 140 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 PSG2P11465 335 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 PRTN3P24158 256 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF136P52737 540 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 CKS1BP61024 79 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 HBA1P69905 142 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 HSD17B12Q53GQ0 312 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 GFI1BQ5VTD9 330 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 KDM4DQ6B0I6 523 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 CASP12Q6UXS9 341 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 Q6ZSR6 202 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 FAM231DQ6ZW35 169 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 CROCCP2Q86T23 111 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 LINC01551Q86U37 167 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 CEND1Q8N111 149 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 OR4E2Q8NGC2 313 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 OR11H6Q8NGC7 330 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 OR9I1Q8NGQ6 314 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 OR8S1Q8NH09 359 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 TERB2Q8NHR7 220 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF675Q8TD23 568 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 CCL17Q92583 94 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 FRZBQ92765 325 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 GALMQ96C23 342 aa1.55□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 PLEKHB2Q96CS7 222 aa1.55□□□□□ -2.16
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