RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496887.6

KCNQ1-205, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 5

Gene KCNQ1, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-205ENST00000496887 COL7A1Q02388 2944 aa12.94□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa12.93□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 DISC1C4P0D8 188 aa12.93□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 SERPINE2P07093 398 aa12.93□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 SYNJ2BPP57105 145 aa12.93□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 OR1L8Q8NGR8 309 aa12.93□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 ELOVL1Q9BW60 279 aa12.93□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 HINT2Q9BX68 163 aa12.93□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa12.93□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 COPZ2Q9P299 210 aa12.93□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 DNAH9Q9NYC9 4486 aa12.93□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 DBX1A6NMT0 343 aa12.92□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 H0Y980 276 aa12.92□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 BMPR1BO00238 502 aa12.92□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 RPEL1Q2QD12 228 aa12.92□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 KLK9Q2XQG4 91 aa12.92□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa12.92□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 OR4C12Q96R67 309 aa12.92□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 TP53RKQ96S44 253 aa12.92□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 KLK9Q9UKQ9 250 aa12.92□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 PRNDQ9UKY0 176 aa12.92□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 S4R3C0 116 aa12.92□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa12.91□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa12.91□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 PPP5D1E7EU14 171 aa12.91□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 IGHV3-23P01764 117 aa12.91□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 OR13C7P0DN81 318 aa12.91□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 S100A5P33763 92 aa12.91□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 WT1-ASQ06250 92 aa12.91□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa12.91□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 OR9G4Q8NGQ1 327 aa12.91□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 TSC22D3Q99576 134 aa12.91□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 TMEM14BQ9NUH8 114 aa12.91□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 FKBP11Q9NYL4 201 aa12.91□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 DMRT1Q9Y5R6 373 aa12.91□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 C15orf61A6NNL5 157 aa12.9□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 LY86O95711 162 aa12.9□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 TATDN3Q17R31 274 aa12.9□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 SP6Q3SY56 376 aa12.9□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 PYDC2Q56P42 97 aa12.9□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 HAPLN4Q86UW8 402 aa12.9□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 GDPD1Q8N9F7 314 aa12.9□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 OR51S1Q8NGJ8 323 aa12.9□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 OR4A16Q8NH70 328 aa12.9□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 PRRT1Q99946 306 aa12.9□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 IGKV1-5P01602 117 aa12.89□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 SPNP16150 400 aa12.89□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 FAM209BQ5JX69 171 aa12.89□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 CLEC19AQ6UXS0 136 aa12.89□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 IL34Q6ZMJ4 242 aa12.89□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa12.89□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 OR5B3Q8NH48 314 aa12.89□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa12.89□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 CCDC140Q96MF4 163 aa12.89□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 C5orf66Q9H5L9 145 aa12.89□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 V9GYH0 126 aa12.89□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 SORL1Q92673 2214 aa12.89□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 MFSD2BA6NFX1 497 aa12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 MECP2P51608 486 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 TRIM16LQ309B1 348 aa12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 SLC25A24Q6NUK1 477 aa12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 Q8N402 240 aa12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 CXorf58Q96LI9 332 aa12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 TMEM56Q96MV1 263 aa12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 SLC2A8Q9NY64 477 aa12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 GPR132Q9UNW8 380 aa12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 CYB5BO43169 146 aa12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 GGCTO75223 188 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 OR2C1O95371 312 aa12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 IGLV1-51P01701 117 aa12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 CSN3P07498 182 aa12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 P0C879 139 aa12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 UCP1P25874 307 aa12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 ARL3P36405 182 aa12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 AKR1C2P52895 323 aa12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 MFAP2P55001 183 aa12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF79Q15937 498 aa12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 CCDC190Q86UF4 302 aa12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 TRIM63Q969Q1 353 aa12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 NAA60Q9H7X0 242 aa12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 MCUBQ9NWR8 336 aa12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 THYN1Q9P016 225 aa12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1-205ENST00000496887 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms