RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 PARLQ9H300 379 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-213ENST00000492657 TMPRSS2O15393 492 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-213ENST00000492657 GFRA3O60609 400 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-213ENST00000492657 KBTBD11O94819 623 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-213ENST00000492657 MBP02144 154 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-213ENST00000492657 PAX1P15863 534 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-213ENST00000492657 RPL23P62829 140 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
PRAME-213ENST00000492657 FOXC1Q12948 553 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-213ENST00000492657 AARDQ4LEZ3 155 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-213ENST00000492657 TMEM108Q6UXF1 575 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-213ENST00000492657 GFRALQ6UXV0 394 aa10.55□□□□□ -0.72
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PRAME-213ENST00000492657 TMEM256Q8N2U0 113 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-213ENST00000492657 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
PRAME-213ENST00000492657 TCF19Q9Y242 345 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-213ENST00000492657 WDR83OSQ9Y284 106 aa10.55□□□□□ -0.72
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PRAME-213ENST00000492657 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP10.55□□□□□ -0.72
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PRAME-213ENST00000492657 ZNF439Q8NDP4 499 aa10.54□□□□□ -0.72
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PRAME-213ENST00000492657 MS4A5Q9H3V2 200 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-213ENST00000492657 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa10.54□□□□□ -0.72
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PRAME-213ENST00000492657 PFN1P07737 140 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
PRAME-213ENST00000492657 CHRNA7P36544 502 aa10.54□□□□□ -0.72
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PRAME-213ENST00000492657 RAB7AP51149 207 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-213ENST00000492657 NUP37Q8NFH4 326 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-213ENST00000492657 PGPEP1LA6NFU8 196 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-213ENST00000492657 IRF2P14316 349 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-213ENST00000492657 TREML4Q6UXN2 200 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-213ENST00000492657 C1orf159Q96HA4 380 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-213ENST00000492657 A0A0U1RQK1 487 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-213ENST00000492657 GRIFINA4D1Z8 144 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-213ENST00000492657 PRSS46E5RG02 174 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-213ENST00000492657 PPP5D1E7EU14 171 aa10.53□□□□□ -0.72
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PRAME-213ENST00000492657 SPACA3Q8IXA5 215 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-213ENST00000492657 OR51G1Q8NGK1 321 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-213ENST00000492657 RND1Q92730 232 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-213ENST00000492657 NEUROG1Q92886 237 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-213ENST00000492657 SRD5A3Q9H8P0 318 aa10.53□□□□□ -0.72
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PRAME-213ENST00000492657 C17orf100A8MU93 164 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-213ENST00000492657 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
PRAME-213ENST00000492657 TMEM250H0YL14 139 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-213ENST00000492657 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
PRAME-213ENST00000492657 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
PRAME-213ENST00000492657 CCL3L1P16619 93 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-213ENST00000492657 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
PRAME-213ENST00000492657 UBE2G2P60604 165 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-213ENST00000492657 MIC13Q5XKP0 118 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-213ENST00000492657 SSMEM1Q8WWF3 244 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-213ENST00000492657 MGST2Q99735 147 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-213ENST00000492657 LRFN3Q9BTN0 628 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-213ENST00000492657 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-213ENST00000492657 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
PRAME-213ENST00000492657 C15orf61A6NNL5 157 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 C17orf112F2Z3M2 114 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 CT45A6P0DMU7 189 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 CT45A5P0DMU8 189 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 CT45A7P0DMV0 189 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 NPPCP23582 126 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 OR52E5Q8NH55 327 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 TMEM208Q9BTX3 173 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
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PRAME-213ENST00000492657 ITGB1BP1O14713 200 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 KIR2DS2P43631 304 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 PCP4P48539 62 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 THBS3P49746 956 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 TBR1Q16650 682 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 TEX36Q5VZQ5 186 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 CCL17Q92583 94 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 FAM122AQ96E09 287 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 LYPD2Q6UXB3 125 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 DIRC2Q96SL1 478 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 MANBALQ9NQG1 85 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 C11orf94C9JXX5 98 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 CA2P00918 260 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
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