RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492182.5

XPO1-222, Transcript of exportin 1, human

TSL 2

Gene XPO1, Length 827 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
XPO1-222	ENST00000492182	PDCD5	O14737	125 aa		7.35	□□□□□ -1.23
XPO1-222	ENST00000492182	YIF1A	O95070	293 aa		7.35	□□□□□ -1.23
XPO1-222	ENST00000492182	S1PR2	O95136	353 aa		7.35	□□□□□ -1.23
XPO1-222	ENST00000492182	GNAO1	P09471	354 aa		7.35	□□□□□ -1.23
XPO1-222	ENST00000492182	C8orf88	P0DMB2	117 aa		7.35	□□□□□ -1.23
XPO1-222	ENST00000492182	TCTA	P57738	103 aa		7.35	□□□□□ -1.23
XPO1-222	ENST00000492182	ZNF124	Q15973	351 aa		7.35	□□□□□ -1.23
XPO1-222	ENST00000492182	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
XPO1-222	ENST00000492182	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		7.35	□□□□□ -1.23
XPO1-222	ENST00000492182	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		7.35	□□□□□ -1.23
XPO1-222	ENST00000492182	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		7.35	□□□□□ -1.23
XPO1-222	ENST00000492182	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		7.35	□□□□□ -1.23
XPO1-222	ENST00000492182	HINT2	Q9BX68	163 aa		7.35	□□□□□ -1.23
XPO1-222	ENST00000492182	C8orf4	Q9NR00	106 aa		7.35	□□□□□ -1.23
XPO1-222	ENST00000492182	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		7.35	□□□□□ -1.23
XPO1-222	ENST00000492182	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		7.34	□□□□□ -1.23
XPO1-222	ENST00000492182	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		7.34	□□□□□ -1.23
XPO1-222	ENST00000492182	MFNG	O00587	321 aa		7.34	□□□□□ -1.23
XPO1-222	ENST00000492182	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
XPO1-222	ENST00000492182	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
XPO1-222	ENST00000492182	CTXN2	P0C2S0	81 aa		7.34	□□□□□ -1.23
XPO1-222	ENST00000492182	MYL9	P24844	172 aa		7.34	□□□□□ -1.23
XPO1-222	ENST00000492182	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
XPO1-222	ENST00000492182	MFAP2	P55001	183 aa		7.34	□□□□□ -1.23
XPO1-222	ENST00000492182	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
XPO1-222	ENST00000492182	ARPC4	P59998	168 aa		7.34	□□□□□ -1.23
XPO1-222	ENST00000492182	ARL6IP1	Q15041	203 aa		7.34	□□□□□ -1.23
XPO1-222	ENST00000492182	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		7.34	□□□□□ -1.23
XPO1-222	ENST00000492182	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		7.34	□□□□□ -1.23
XPO1-222	ENST00000492182	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		7.34	□□□□□ -1.23
XPO1-222	ENST00000492182	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		7.34	□□□□□ -1.23
XPO1-222	ENST00000492182	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		7.34	□□□□□ -1.23
XPO1-222	ENST00000492182	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		7.34	□□□□□ -1.23
XPO1-222	ENST00000492182	GPHA2	Q96T91	129 aa		7.34	□□□□□ -1.23
XPO1-222	ENST00000492182	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
XPO1-222	ENST00000492182	VCX	Q9H320	206 aa		7.34	□□□□□ -1.23
XPO1-222	ENST00000492182	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		7.33	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182		A0A1B0GW64	132 aa		7.33	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	C11orf94	C9JXX5	98 aa		7.33	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	NDUFA4	O00483	81 aa		7.33	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	HLA-DQB1	P01920	261 aa		7.33	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		7.33	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	7.33	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	GNG2	P59768	71 aa		7.33	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	PAFAH1B2	P68402	229 aa		7.33	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	CATR1	Q13166	79 aa		7.33	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	TMEM187	Q14656	261 aa		7.33	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	SSX1	Q16384	188 aa		7.33	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		7.33	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		7.33	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		7.33	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	BET1L	Q9NYM9	111 aa		7.33	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	SULT1C2	O00338	296 aa		7.32	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	OR13C7	P0DN81	318 aa		7.32	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	DTYMK	P23919	212 aa		7.32	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	OR10A3	P58181	314 aa		7.32	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	OR2B8P	P59922	312 aa		7.32	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	ERVK-16	P61578	105 aa		7.32	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	FABP5	Q01469	135 aa		7.32	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	CDNF	Q49AH0	187 aa		7.32	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	XP32	Q5T750	250 aa		7.32	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		7.32	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		7.32	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		7.32	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		7.32	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		7.32	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	RNF2	Q99496	336 aa		7.32	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		7.32	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		7.32	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		7.31	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		7.31	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		7.31	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	SMIM30	A4D0T7	59 aa		7.31	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		7.31	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182		M0R2N4	97 aa		7.31	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		7.31	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		7.31	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	CD37	P11049	281 aa		7.31	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	NQO2	P16083	231 aa		7.31	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	RAB3B	P20337	219 aa		7.31	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	FXYD4	P59646	89 aa		7.31	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	RCN1	Q15293	331 aa		7.31	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		7.31	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	LEMD1	Q68G75	181 aa		7.31	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	CNIH2	Q6PI25	160 aa		7.31	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182		Q6ZS49	121 aa		7.31	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	STH	Q8IWL8	128 aa		7.31	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		7.31	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		7.31	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		7.31	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		7.31	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	OR51H1	Q8NH63	302 aa		7.31	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		7.31	□□□□□ -1.24
XPO1-222	ENST00000492182	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		7.31	□□□□□ -1.24

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