RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa14.51□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NBEAP1P0C6P0 100 aa14.51□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TCF23Q7RTU1 214 aa14.51□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SYNGR3O43761 229 aa14.51□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SERF1AO75920 110 aa14.51□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CSRP2Q16527 193 aa14.51□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C18orf12Q96KH6 178 aa14.51□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPCS1Q9Y6A9 102 aa14.51□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa14.5□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IZUMO1RA6ND01 250 aa14.5□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ADMP35318 185 aa14.5□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM170BQ5T4T1 132 aa14.5□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LRTM2Q8N967 370 aa14.5□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM170AQ8WVE7 144 aa14.5□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CLEC7AQ9BXN2 247 aa14.5□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MIR17HGQ75NE6 70 aa14.5□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa14.5□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TNFSF10P50591 281 aa14.5□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa14.49□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa14.49□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MUC21A0A140T8X8 626 aa14.49□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NPPCP23582 126 aa14.49□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CTSSP25774 331 aa14.49□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LY6G6FQ5SQ64 297 aa14.49□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MUC21Q5SSG8 566 aa14.49□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ACP7Q6ZNF0 438 aa14.49□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FOXC2Q99958 501 aa14.49□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 WDR82Q6UXN9 313 aa14.49□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NEUROG1Q92886 237 aa14.49□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RAB9AP51151 201 aa14.49□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C10orf126Q8N4M7 172 aa14.49□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TEX45Q8NA69 505 aa14.49□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FMC1Q96HJ9 113 aa14.49□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NDUFAF3Q9BU61 184 aa14.49□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRAV24A0A0B4J272 114 aa14.49□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EFEMP2O95967 443 aa14.49□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DNM1P46Q6ZS02 220 aa14.49□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NRN1Q9NPD7 142 aa14.49□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa14.49□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PNKDQ8N490 385 aa14.49□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa14.49□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM106AQ4KMX7 169 aa14.48□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IGLV3-19P01714 112 aa14.48□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IGHV3-23P01764 117 aa14.48□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LINC00114Q6XXX2 140 aa14.48□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A0A1B0GUT8 65 aa14.48□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C9orf172C9J069 976 aa14.48□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RP1P56715 2156 aa14.48□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UBE2CO00762 179 aa14.48□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RAX2Q96IS3 184 aa14.47□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRDM13Q9H4Q3 707 aa14.47□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCDC88CQ9P219 2028 aa14.47□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa14.47□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 F8VVB4 439 aa14.47□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 F8VWA3 439 aa14.47□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM159AQ6UWV7 190 aa14.47□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C19orf67A6NJJ6 358 aa14.47□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CLDN16Q9Y5I7 305 aa14.47□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CA1P00915 261 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa14.47□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa14.47□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DNAL4O96015 105 aa14.46□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa14.46□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MRAP2Q96G30 205 aa14.46□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SCGB3A1Q96QR1 104 aa14.46□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NPFFO15130 113 aa14.46□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HIST1H2BKO60814 126 aa14.46□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ATP5LO75964 103 aa14.46□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HIST1H2BJP06899 126 aa14.46□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HIST1H2BOP23527 126 aa14.46□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HIST1H2BBP33778 126 aa14.46□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HIST1H2BDP58876 126 aa14.46□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HIST1H2BCP62807 126 aa14.46□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LY6EQ16553 131 aa14.46□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HIST2H2BEQ16778 126 aa14.46□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR13A1Q8NGR1 328 aa14.46□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR52E5Q8NH55 327 aa14.46□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HIST1H2BHQ93079 126 aa14.46□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HIST1H2BNQ99877 126 aa14.46□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HIST1H2BMQ99879 126 aa14.46□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DERL1Q9BUN8 251 aa14.46□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 S4R3C0 116 aa14.46□□□□□ -0.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LOC105371242A0A075B767 164 aa14.46□□□□□ -0.1
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa14.46□□□□□ -0.1
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 J3QW42 95 aa14.46□□□□□ -0.1
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TIAF1O95411 115 aa14.46□□□□□ -0.1
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TYMSP04818 313 aa14.46□□□□□ -0.1
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TSPOP30536 169 aa14.46□□□□□ -0.1
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CLEC2AQ6UVW9 174 aa14.46□□□□□ -0.1
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPSB2Q99619 263 aa14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.9 ms