RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463209.1

TMEM254-208, Transcript of transmembrane protein 254, human

TSL 3

Gene TMEM254, Length 407 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM254-208	ENST00000463209	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		6.57	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		6.57	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		6.57	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	OR2C1	O95371	312 aa		6.57	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	BRI3	O95415	125 aa		6.57	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	IGKV1-5	P01602	117 aa		6.57	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	CRYGC	P07315	174 aa		6.57	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	CSN3	P07498	182 aa		6.57	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		6.57	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		6.57	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	OR13C7	P0DN81	318 aa		6.57	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	ZP3	P21754	424 aa		6.57	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	ARL3	P36405	182 aa		6.57	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	UCP3	P55916	312 aa		6.57	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	CD69	Q07108	199 aa		6.57	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		6.57	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		6.57	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		6.57	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	SEC22A	Q96IW7	307 aa		6.57	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	COL7A1	Q02388	2944 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209		A0A0G2JRQ6	117 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	FABP12	A6NFH5	140 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	C15orf61	A6NNL5	157 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209		H0Y980	276 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	SNAPC5	O75971	98 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	IGHV3-48	P01763	117 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	SERPINE2	P07093	398 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	GP9	P14770	177 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	S100G	P29377	79 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	GPR183	P32249	361 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	TRIM16L	Q309B1	348 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	TERB2	Q8NHR7	220 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	MCUB	Q9NWR8	336 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209		V9GYH0	126 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	DISC1	C4P0D8	188 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	CTDSPL	O15194	276 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	NXPH3	O95157	252 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	IGLV1-51	P01701	117 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	OR5AC1	P0C628	307 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	AKAIN1	P0CW23	69 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	TBP	P20226	339 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	INSL3	P51460	131 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	RND3	P61587	244 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	MEF2D	Q14814	521 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	PYDC2	Q56P42	97 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	OR4A16	Q8NH70	328 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	B9D2	Q9BPU9	175 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	COPZ2	Q9P299	210 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	PRND	Q9UKY0	176 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		6.54	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	ZNF320	A2RRD8	509 aa		6.54	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	OR2T8	A6NH00	312 aa		6.54	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	TPPP	O94811	219 aa		6.54	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	DHFR	P00374	187 aa		6.54	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	CLEC3B	P05452	202 aa		6.54	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	AKR1C2	P52895	323 aa		6.54	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	ZNF79	Q15937	498 aa		6.54	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		6.54	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		6.54	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	TRIM63	Q969Q1	353 aa		6.54	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	TMEM230	Q96A57	120 aa		6.54	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	MISP3	Q96FF7	219 aa		6.54	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	SOST	Q9BQB4	213 aa		6.54	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
TMEM254-208	ENST00000463209	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms