RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 MGST2Q99735 147 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 RARRES2Q99969 163 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 GGTLC1Q9BX51 225 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 TPSG1Q9NRR2 321 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 PRNDQ9UKY0 176 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1W2PPI3 338 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 COLCA2A8K830 154 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 ODF3BA8MYP8 253 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 E7EUB6 86 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 H7C2Y5 167 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 OVOL3O00110 214 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 LY6HO94772 140 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 SNAPINO95295 136 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 CA2P00918 260 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 IFNA17P01571 189 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 LINC00869P0C866 280 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 BCL2P10415 239 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 FGF7P21781 194 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 USF1P22415 310 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 GNLYP22749 145 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 NPY1RP25929 384 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 CD1BP29016 333 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 OPRK1P41145 380 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 PPT1P50897 306 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 ETV3LQ6ZN32 361 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 CBLN2Q8IUK8 224 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 SLC24A4Q8NFF2 622 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 OR11H6Q8NGC7 330 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 OR1L8Q8NGR8 309 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 SCGB1C1Q8TD33 95 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 SFT2D1Q8WV19 159 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 RAB39BQ96DA2 213 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 RITA1Q96K30 269 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 PBDC1Q9BVG4 233 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 TUBA4BQ9H853 241 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 MIOXQ9UGB7 285 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 WASHC3Q9Y3C0 194 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 OR51B2Q9Y5P1 312 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 AKAP6Q13023 2319 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 CENPEQ02224 2701 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 COL12A1Q99715 3063 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 C7orf77A4D0Y5 90 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 PSMB11A5LHX3 300 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 M0R1W7 72 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 MBP02144 154 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 APOA2P02652 100 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 PRB1P04280 392 aa4.54□□□□□ -1.68
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PTPRC-210ENST00000462363 MC5RP33032 325 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 CD81P60033 236 aa4.54□□□□□ -1.68
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PTPRC-210ENST00000462363 RPL8P62917 257 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 TNP2Q05952 138 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 WT1-ASQ06250 92 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 AWAT1Q58HT5 328 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 AVPI1Q5T686 147 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM88Q6PEY1 159 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 KIR3DL3Q8N743 410 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF114Q8NC26 417 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 OR4C13Q8NGP0 309 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 CFHR4Q92496 578 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 LHX4Q969G2 390 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 RAB24Q969Q5 203 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 HARBI1Q96MB7 349 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 P2RX4Q99571 388 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 RAB1BQ9H0U4 201 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 CHODLQ9H9P2 273 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 FKBP11Q9NYL4 201 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 SLC45A2Q9UMX9 530 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 CELSR2Q9HCU4 2923 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 CACNA1BQ00975 2339 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 A0A087WWC5 75 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1B0GV50 99 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 IGLC7A0M8Q6 106 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 J3QKU1 62 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 GOSR1O95249 250 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 IFNA10P01566 189 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 LIPFP07098 398 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 FBP1P09467 338 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 STAG3L2P0CL84 134 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 STAG3L3P0CL85 134 aa4.53□□□□□ -1.68
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