RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 WT1-ASQ06250 92 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 IL18Q14116 193 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF79Q15937 498 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 DMBX1Q8NFW5 382 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 OR4C16Q8NGL9 310 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 OR4A5Q8NH83 315 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 MCFD2Q8NI22 146 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 LHFPL5Q8TAF8 219 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 VSTM2AQ8TAG5 236 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 MARCH1Q8TCQ1 289 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 SMIM4Q8WVI0 70 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF414Q96IQ9 312 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC140Q96MF4 163 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 SPIN2AQ99865 258 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 DNAH7Q8WXX0 4024 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A0G2JLM5 398 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 IZUMO1RA6ND01 250 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 FABP12A6NFH5 140 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC160A6NGH7 325 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 MARCH11A6NNE9 402 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 ACTL6BO94805 426 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 CSN3P07498 182 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 PIGPP57054 158 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 SYNJ2BPP57105 145 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 TAS2R19P59542 299 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 C15orf32Q32M92 178 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 DEFB121Q5J5C9 76 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 C11orf87Q6NUJ2 197 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 Q6ZRM9 215 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC38A6Q8IZM9 456 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 TERB2Q8NHR7 220 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM230Q96A57 120 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 USMG5Q96IX5 58 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 C5orf66Q9H5L9 145 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 PRR13Q9NZ81 148 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 COMMD9Q9P000 198 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 FBXL7Q9UJT9 491 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 GPR132Q9UNW8 380 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 SELENOKQ9Y6D0 94 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 V9GYH0 126 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A0B4J293 547 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 DPPA5A6NC42 116 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 F8W735 103 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 SAP30O75446 220 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 OR2C1O95371 312 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 IFNA6P05013 189 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 AKAIN1P0CW23 69 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 TRAPPC2P0DI81 140 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 TRAPPC2BP0DI82 140 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 SPNP16150 400 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 CD40LGP29965 261 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 MECP2P51608 486 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP5G2Q06055 141 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 SPINK9Q5DT21 86 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 LPCAT3Q6P1A2 487 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 CLEC19AQ6UXS0 136 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC190Q86UF4 302 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 CMTM1Q8IZ96 169 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 CADM3Q8N126 398 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 ARRDC1Q8N5I2 433 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 OR51S1Q8NGJ8 323 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 OR1L8Q8NGR8 309 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 CD300LFQ8TDQ1 290 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 GLYATL2Q8WU03 294 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 CLUHP3Q96NS8 147 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM14BQ9NUH8 114 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 OR51B2Q9Y5P1 312 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM223BA6NKX1 122 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 C15orf61A6NNL5 157 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 H0Y980 276 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 NOL3O60936 208 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 IGLV1-51P01701 117 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 SERPINE2P07093 398 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 OR5AC1P0C628 307 aa5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms