RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 GDPD1Q8N9F7 314 aa15.73■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 ATP6V0BQ99437 205 aa15.73■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 FAM110AQ9BQ89 295 aa15.73■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 FCER2P06734 321 aa15.72■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 F2RP25116 425 aa15.72■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 GPR183P32249 361 aa15.72■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 OR52B4Q8NGK2 314 aa15.72■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 UFC1Q9Y3C8 167 aa15.72■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 MEIS3P1A6NDR6 274 aa15.71■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 SERPINE2P07093 398 aa15.71■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 TRAPPC2P0DI81 140 aa15.71■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 TRAPPC2BP0DI82 140 aa15.71■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 TAS2R46P59540 309 aa15.71■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 ERVK-16P61578 105 aa15.71■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 TM4SF20Q53R12 229 aa15.71■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 PLET1Q6UQ28 207 aa15.71■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 BTNL8Q6UX41 500 aa15.71■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 TGOLN2O43493 480 aa15.7■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 RLN1P04808 185 aa15.7■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 TAS2R20P59543 309 aa15.7■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 WT1-ASQ06250 92 aa15.7■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM69Q5SWH9 247 aa15.7■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 CMTM1Q8IZ96 169 aa15.7■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 OR10W1Q8NGF6 305 aa15.7■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 OR1L8Q8NGR8 309 aa15.7■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM190Q8WZ59 177 aa15.7■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa15.7■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa15.69■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 TGFBR1P36897 503 aa15.69■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 RPS19P39019 145 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 RFX2P48378 723 aa15.69■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 SPSB3Q6PJ21 355 aa15.69■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 OR5H2Q8NGV7 314 aa15.69■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 YIPF6Q96EC8 236 aa15.69■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 GGTLC1Q9BX51 225 aa15.69■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 C5orf66Q9H5L9 145 aa15.69■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 OR13C7P0DN81 318 aa15.68■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 SAMD12Q8N8I0 201 aa15.68■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 OR1L6Q8NGR2 347 aa15.68■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 FCAMRQ8WWV6 532 aa15.68■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 FXYD6Q9H0Q3 95 aa15.68■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 GPR31O00270 319 aa15.67■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 JTBO76095 146 aa15.67■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 PMP2P02689 132 aa15.67■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 PRSS3P35030 304 aa15.67■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF585BQ52M93 769 aa15.67■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 OR6F1Q8NGZ6 308 aa15.67■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 SELENOKQ9Y6D0 94 aa15.67■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 NDUFA4O00483 81 aa15.66■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 LPAR6P43657 344 aa15.66■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 OR2C3Q8N628 320 aa15.66■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 OR5B3Q8NH48 314 aa15.66■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 VCX3AQ9NNX9 186 aa15.66■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 FKBP11Q9NYL4 201 aa15.66■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 PRNDQ9UKY0 176 aa15.66■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 OR51B2Q9Y5P1 312 aa15.66■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 OR2T8A6NH00 312 aa15.65■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 TSPAN4O14817 238 aa15.65■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 SNAPC5O75971 98 aa15.65■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 KRASP01116 189 aa15.65■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 RPA2P15927 270 aa15.65■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 MFAP2P55001 183 aa15.65■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 SLC25A24Q6NUK1 477 aa15.65■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 GPX8Q8TED1 209 aa15.65■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 SLC25A46Q96AG3 418 aa15.65■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM56Q96MV1 263 aa15.65■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 CMTM3Q96MX0 182 aa15.65■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 TSC22D3Q99576 134 aa15.65■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM14BQ9NUH8 114 aa15.65■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 C21orf62Q9NYP8 219 aa15.65■□□□□ 0.1
LIMS1-208ENST00000428064 BIRC6Q9NR09 4857 aa15.64■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 A0A087WXM4 84 aa15.64■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa15.64■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 F8W735 103 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 HRH1P35367 487 aa15.64■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 G6PCP35575 357 aa15.64■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 LPCAT3Q6P1A2 487 aa15.64■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 LYSMD2Q8IV50 215 aa15.64■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 SLC38A6Q8IZM9 456 aa15.64■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 TSPAN14Q8NG11 270 aa15.64■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 SCARB1Q8WTV0 552 aa15.64■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 OVOL2Q9BRP0 275 aa15.64■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa15.64■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 C15orf61A6NNL5 157 aa15.63■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 K7EIM0 57 aa15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms