RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417027.1

RPS3AP9-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 9, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP9, Length 792 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP9-201ENST00000417027 SLC17A3O00476 420 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 PLA2G10O15496 165 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 PDE6DO43924 150 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 KCNE1P15382 129 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 TBPL1P62380 186 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 RPL19P84098 196 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 GNA12Q03113 381 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 HTR4Q13639 388 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 GRK1Q15835 563 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 LGALS9BQ3B8N2 356 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 PYCR3Q53H96 274 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 LGALS9CQ6DKI2 356 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 OR8B12Q8NGG6 310 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 OR51A2Q8NGJ7 313 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 FNDC9Q8TBE3 224 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 NEK7Q8TDX7 302 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 RAD51AP1Q96B01 352 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 BORCS7Q96B45 105 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 CISHQ9NSE2 258 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 ASF1BQ9NVP2 202 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 ARMC1Q9NVT9 282 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 VCANP13611 3396 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 TTC28Q96AY4 2481 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 DCCP43146 1447 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 A2MP01023 1474 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 MLH3Q9UHC1 1453 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 DUOX2Q9NRD8 1548 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 FAM135AQ9P2D6 1515 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 CFAP74Q9C0B2 1584 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 IQGAP3Q86VI3 1631 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 MROH2AA6NES4 1674 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 KIAA1671Q9BY89 1806 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 hADV38S2A0JD32 116 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 FAM159BA6NKW6 160 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 C17orf98A8MV24 154 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 OR11H12B2RN74 326 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 I3L521 148 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 CRHBPP24387 322 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 DEFA3P59666 94 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 RPL30P62888 115 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 HIST1H3AP68431 136 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 H3F3AP84243 136 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 LYG2Q86SG7 212 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 OR11H2Q8NH07 326 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 MCFD2Q8NI22 146 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 MUC7Q8TAX7 377 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 OR8B2Q96RD0 313 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 PRRT1Q99946 306 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 TMEM147Q9BVK8 224 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 AK3Q9UIJ7 227 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 SSH2Q76I76 1423 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 ABCC3O15438 1527 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 CLTCL1P53675 1640 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF462Q96JM2 2506 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 A0A087WUU8 490 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 A0A0J9YY10 115 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 A0A1B0GU33 70 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 A0A1B0GX78 115 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 DHRS12A0PJE2 317 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 OR2B3O76000 313 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 CRYZL1O95825 349 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 LPAR6P43657 344 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 GABRA2P47869 451 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 RAB13P51153 203 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 DR1Q01658 176 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 CAV1Q03135 178 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 GLT8D1Q68CQ7 371 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZFAND6Q6FIF0 208 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 OR10P1Q8NGE3 313 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 OR13C8Q8NGS7 320 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 ROPN1LQ96C74 230 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 TTTY13Q9BZ97 58 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.6 ms