RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 MECP2P51608 486 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 RND3P61587 244 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 GUCA2BQ16661 112 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 C10orf55Q5SWW7 151 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 LPCAT3Q6P1A2 487 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 CMTM1Q8IZ96 169 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 SLC38A6Q8IZM9 456 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 DEFB125Q8N687 156 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 NECAP1Q8NC96 275 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 OR4D10Q8NGI6 311 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 OR51H1Q8NH63 302 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 SPIN2AQ99865 258 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 NPIPB5A8MRT5 1133 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 OR11H12B2RN74 326 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 UPK2O00526 184 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 CRYGCP07315 174 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 CD7P09564 240 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 TNFSF8P32971 234 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 TAS2R19P59542 299 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 TSPAN5P62079 268 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 RPL8P62917 257 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 ZNF45Q02386 682 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 SLC16A13Q7RTY0 426 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 DIRAS2Q96HU8 199 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 SLC2A9Q9NRM0 540 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 HYDINQ4G0P3 5121 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 TRAV3A0A0B4J244 114 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 MARCH11A6NNE9 402 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 ZNF785A8K8V0 405 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 PRH1P02810 166 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 FOLR2P14207 255 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 HLA-GP17693 338 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 OR2B8PP59922 312 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 DEFB114Q30KQ6 69 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 C15orf32Q32M92 178 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 STEAP1BQ6NZ63 245 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 SLC25A42Q86VD7 318 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 MCFD2Q8NI22 146 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 WFDC10AQ9H1F0 79 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 TMEM140Q9NV12 185 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 V9GYH0 126 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 C2orf70A6NJV1 201 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 RAB3DO95716 219 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 IGKV1-39P01597 117 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 IGKV1D-39P04432 117 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 CTRB1P17538 263 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 IL18Q14116 193 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 CTRB2Q6GPI1 263 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 SSX9Q7RTT3 188 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 TBC1D26Q86UD7 250 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 TERB2Q8NHR7 220 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 SEC22AQ96IW7 307 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 IGLC7A0M8Q6 106 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 PPP5D1E7EU14 171 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 GGCTO75223 188 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 OR2J3O76001 311 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 P0C879 139 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 MYOD1P15172 320 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 LPAR6P43657 344 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 MEF2DQ14814 521 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 ZNF79Q15937 498 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 PHLDA2Q53GA4 152 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 CCDC190Q86UF4 302 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 OR4C16Q8NGL9 310 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 TRIM63Q969Q1 353 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 FANCD2OSQ96PS1 177 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 DMRT1Q9Y5R6 373 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-204ENST00000403441 DPPA5A6NC42 116 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 CXorf65A6NEN9 183 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 FABP12A6NFH5 140 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 HMX3A6NHT5 357 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 LGALS9O00182 355 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 AKAIN1P0CW23 69 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 AREGP15514 252 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 RPA2P15927 270 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 PSMB6P28072 239 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 S100GP29377 79 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 ETV6P41212 452 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PRAME-204ENST00000403441 DMBX1Q8NFW5 382 aa9.27□□□□□ -0.93
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