RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 TSPAN15O95858 294 aa23.43■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 AREGP15514 252 aa23.43■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 SLC35G3Q8N808 338 aa23.43■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa23.43■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa23.43■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 NUDT15Q9NV35 164 aa23.43■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 ANKRD55Q3KP44 614 aa23.42■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 Q6ZRM9 215 aa23.42■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 LGI3Q8N145 548 aa23.42■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF491Q8N8L2 437 aa23.42■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 OR10W1Q8NGF6 305 aa23.42■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 OR5B3Q8NH48 314 aa23.42■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 COA4Q9NYJ1 87 aa23.42■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 IGLC7A0M8Q6 106 aa23.41■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 H3BUA1 57 aa23.41■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 TRAPPC2P0DI81 140 aa23.41■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 TRAPPC2BP0DI82 140 aa23.41■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 RGS21Q2M5E4 152 aa23.41■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 FAM219AQ8IW50 185 aa23.41■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 SLA2Q9H6Q3 261 aa23.41■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 TRAV6A0A075B6T7 132 aa23.4■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 BRI3O95415 125 aa23.4■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 OR4E1P0C645 316 aa23.4■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 SRPXP78539 464 aa23.4■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 C19orf35Q6ZS72 473 aa23.4■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 LYZL2Q7Z4W2 148 aa23.4■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF429Q86V71 674 aa23.4■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa23.4■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 GPR146Q96CH1 333 aa23.4■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 UBE2E2Q96LR5 201 aa23.4■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 A0A0B4J2A0 478 aa23.4■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 C9orf170A2RU37 121 aa23.4■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 NPIPB5A8MRT5 1133 aa23.4■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 TRGV3P03979 118 aa23.4■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 HINT2Q9BX68 163 aa23.4■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 SHPKQ9UHJ6 478 aa23.4■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa23.4■■□□□ 1.34
PKDCC-202ENST00000401498 PRH1P02810 166 aa23.39■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 REG1AP05451 166 aa23.39■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 CRYGCP07315 174 aa23.39■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 PSMB6P28072 239 aa23.39■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 TPPP2P59282 170 aa23.39■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 PRR31Q5SQ13 230 aa23.39■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 C8orf86Q6ZUL3 223 aa23.39■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 LRTM2Q8N967 370 aa23.39■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 CTRB1P17538 263 aa23.38■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 WT1-ASQ06250 92 aa23.38■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 DHRS2Q13268 280 aa23.38■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 CTRB2Q6GPI1 263 aa23.38■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 GNB4Q9HAV0 340 aa23.38■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 NUDT19A8MXV4 375 aa23.37■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 PLET1Q6UQ28 207 aa23.37■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 OR4F17Q8NGA8 305 aa23.37■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 OR4F4Q96R69 305 aa23.37■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 CMYA5Q8N3K9 4069 aa23.37■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 H2AFB2P0C5Z0 115 aa23.36■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 RAB25P57735 213 aa23.36■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 C4orf46Q504U0 113 aa23.36■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 NMSQ5H8A3 153 aa23.36■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 LYG2Q86SG7 212 aa23.36■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 CACNG5Q9UF02 275 aa23.36■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 ST8SIA3O43173 380 aa23.35■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 MECP2P51608 486 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 DEFA5Q01523 94 aa23.35■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 C4orf3Q8WVX3 66 aa23.35■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 MARVELD1Q9BSK0 173 aa23.35■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 OR13C7P0DN81 318 aa23.35■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 PRCDQ00LT1 54 aa23.35■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 OXA1LQ15070 435 aa23.35■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 OR5B12Q96R08 314 aa23.35■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa23.34■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 AARDQ4LEZ3 155 aa23.34■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa23.33■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa23.33■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 I3L521 148 aa23.33■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 DEFB136Q30KP8 78 aa23.33■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 SPINK9Q5DT21 86 aa23.33■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 FANCD2OSQ96PS1 177 aa23.33■■□□□ 1.33
PKDCC-202ENST00000401498 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
PKDCC-202ENST00000401498 IGHV3-11P01762 117 aa23.32■■□□□ 1.32
PKDCC-202ENST00000401498 KLK9Q2XQG4 91 aa23.32■■□□□ 1.32
PKDCC-202ENST00000401498 ETV3LQ6ZN32 361 aa23.32■■□□□ 1.32
PKDCC-202ENST00000401498 OR52B4Q8NGK2 314 aa23.32■■□□□ 1.32
PKDCC-202ENST00000401498 KLK9Q9UKQ9 250 aa23.32■■□□□ 1.32
PKDCC-202ENST00000401498 IFNA17P01571 189 aa23.31■■□□□ 1.32
PKDCC-202ENST00000401498 RHOGP84095 191 aa23.31■■□□□ 1.32
PKDCC-202ENST00000401498 RUNX1Q01196 453 aa23.31■■□□□ 1.32
PKDCC-202ENST00000401498 RAX2Q96IS3 184 aa23.31■■□□□ 1.32
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