RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398743.6

PRAME-202, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAME, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-202ENST00000398743 ABHD5Q8WTS1 349 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 NEUROG1Q92886 237 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 HARBI1Q96MB7 349 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 TXNDC17Q9BRA2 123 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 E7EQL1 145 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 F6UZH7 168 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 CLN5O75503 358 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 HOXA5P20719 270 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 NPPCP23582 126 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 S100PP25815 95 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 RPL29P47914 159 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 NDUFA6P56556 154 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 LYPD2Q6UXB3 125 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 SLC16A13Q7RTY0 426 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 OR51G1Q8NGK1 321 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 NANPQ8TBE9 248 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 ANAPC16Q96DE5 110 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 OR5B12Q96R08 314 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 VKORC1Q9BQB6 163 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 KALRNO60229 2985 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 FAM87AP0C7U9 286 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 RHOBP62745 196 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 EFNB3Q15768 340 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 OR5AN1Q8NGI8 311 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 OR10X1Q8NGY0 326 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 H0YJW9 148 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 DVL1O14640 695 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 PFN1P07737 140 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 IGFBP2P18065 325 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 GALR1P47211 349 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 GNB1P62873 340 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 FAM71F2Q6NXP2 309 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 NECAP1Q8NC96 275 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 ICE1Q9Y2F5 2266 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 REG1BP48304 166 aa11.27□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 TMEM177Q53S58 311 aa11.27□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 C2orf83Q53S99 150 aa11.27□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 KAAG1Q9UBP8 84 aa11.27□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 CTSZQ9UBR2 303 aa11.27□□□□□ -0.6
PRAME-202ENST00000398743 NDUFB4O95168 129 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 TRGC1P0CF51 173 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 PRR20EP86478 221 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 PRR20CP86479 221 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 PRR20DP86480 221 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 PRR20BP86481 221 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 PRR20AP86496 221 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 LINC00311Q8N616 119 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 C8orf31Q8N9H6 132 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 OR1L8Q8NGR8 309 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 FRZBQ92765 325 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 TMEM186Q96B77 213 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 PYGO2Q9BRQ0 406 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 COMMD5Q9GZQ3 224 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 APC2O95996 2303 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 LOXP28300 417 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 CHRNB4P30926 498 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 TMEM144Q7Z5S9 345 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 LINC01551Q86U37 167 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 PDPNQ86YL7 162 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 OR4C13Q8NGP0 309 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 ZNF596Q8TC21 504 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 SRD5A3Q9H8P0 318 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 ACACAQ13085 2346 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 B9A039 149 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 MT-CO2P00403 227 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 CD3EP07766 207 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 GCHFRP30047 84 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 RPL8P62917 257 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 OR5T1Q8NG75 326 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 VSTM2AQ8TAG5 236 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 DERL1Q9BUN8 251 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 USF1P22415 310 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 C4orf17Q53FE4 359 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 FAM122AQ96E09 287 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 NABP2Q9BQ15 211 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 ZGRF1Q86YA3 2104 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 PPP5D1E7EU14 171 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 PHOX2AO14813 284 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 PPP1R2P9O14990 202 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 LINC00869P0C866 280 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 SRP14P37108 136 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 TMEM155Q4W5P6 130 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 FAM78BQ5VT40 261 aa11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms