RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 RNF5Q99942 180 aa4.85□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 GGACTQ9BVM4 153 aa4.85□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 SCRT1Q9BWW7 348 aa4.85□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 SH3BGRL3Q9H299 93 aa4.85□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 FKBP11Q9NYL4 201 aa4.85□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 WASHC3Q9Y3C0 194 aa4.85□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 TIMM9Q9Y5J7 89 aa4.85□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 KPTNQ9Y664 436 aa4.85□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa4.84□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa4.84□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 A0A1B0GW64 132 aa4.84□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 CEBPZOSA8MTT3 80 aa4.84□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 VWC2LB2RUY7 222 aa4.84□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 KRBOX1C9JBD0 128 aa4.84□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 FNDC10F2Z333 226 aa4.84□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 NDUFS8O00217 210 aa4.84□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 SHOXO15266 292 aa4.84□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 ENSAO43768 121 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 IFNA5P01569 189 aa4.84□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 IFNA17P01571 189 aa4.84□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 ZP3P21754 424 aa4.84□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 USF1P22415 310 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 PDLIM4P50479 330 aa4.84□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 F2RL1P55085 397 aa4.84□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 RPP30P78346 268 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 SERF2P84101 59 aa4.84□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa4.84□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 PVRIGQ6DKI7 326 aa4.84□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 TEX45Q8NA69 505 aa4.84□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa4.84□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 VSTM2AQ8TAG5 236 aa4.84□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 HARBI1Q96MB7 349 aa4.84□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM147Q9BVK8 224 aa4.84□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 SIRPDQ9H106 197 aa4.84□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa4.84□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa4.83□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa4.83□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 A0A1W2PPI3 338 aa4.83□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 CGB1A6NKQ9 187 aa4.83□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 OOSP1A8MZH6 123 aa4.83□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 TEX46H3BTG2 121 aa4.83□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 I3L521 148 aa4.83□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 RRHO14718 337 aa4.83□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 SOX15O60248 233 aa4.83□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 CD5P06127 495 aa4.83□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 REG1BP48304 166 aa4.83□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 DLK1P80370 383 aa4.83□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 RUNX1Q01196 453 aa4.83□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 PMS2P11Q13670 270 aa4.83□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 C2orf83Q53S99 150 aa4.83□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 C10orf91Q5T1B1 145 aa4.83□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa4.83□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 MINOS1Q5TGZ0 78 aa4.83□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 SPSB3Q6PJ21 355 aa4.83□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 Q6ZRG5 221 aa4.83□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 PNKDQ8N490 385 aa4.83□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 OR10P1Q8NGE3 313 aa4.83□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 OR1L8Q8NGR8 309 aa4.83□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 CLDND2Q8NHS1 167 aa4.83□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 C10orf105Q8TEF2 133 aa4.83□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 CFHR4Q92496 578 aa4.83□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP4.83□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 C1orf159Q96HA4 380 aa4.83□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 RITA1Q96K30 269 aa4.83□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 CCL19Q99731 98 aa4.83□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 BPESC1Q9GZL8 116 aa4.83□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 UQCC1Q9NVA1 299 aa4.83□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 DPM3Q9P2X0 92 aa4.83□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 ONECUT1Q9UBC0 465 aa4.83□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 WDR83OSQ9Y284 106 aa4.83□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 OR51B2Q9Y5P1 312 aa4.83□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 RFNGQ9Y644 331 aa4.83□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa4.83□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa4.82□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 BTBD17A6NE02 478 aa4.82□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 FAM157AC9JC47 383 aa4.82□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 H7C2Y5 167 aa4.82□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 MPDU1O75352 247 aa4.82□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 FOXH1O75593 365 aa4.82□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 MYOD1P15172 320 aa4.82□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 COX7A1P24310 79 aa4.82□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 HTR1DP28221 377 aa4.82□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 CD1BP29016 333 aa4.82□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 MAS1LP35410 378 aa4.82□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 SNCAP37840 140 aa4.82□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 CEACAM3P40198 252 aa4.82□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 CAMLGP49069 296 aa4.82□□□□□ -1.64
C6orf48-208ENST00000395788 FHITP49789 147 aa4.82□□□□□ -1.64
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