RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373619.7

CITED1-202, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 886 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-202ENST00000373619 PLEKHA2Q9HB19 425 aa10.65□□□□□ -0.7
CITED1-202ENST00000373619 AKIP1Q9NQ31 210 aa10.65□□□□□ -0.7
CITED1-202ENST00000373619 BET1LQ9NYM9 111 aa10.65□□□□□ -0.7
CITED1-202ENST00000373619 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
CITED1-202ENST00000373619 RABL2BQ9UNT1 228 aa10.65□□□□□ -0.7
CITED1-202ENST00000373619 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa10.64□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 TEX22C9J3V5 150 aa10.64□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 UPK2O00526 184 aa10.64□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 TRBV12-3P01733 135 aa10.64□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 NQO2P16083 231 aa10.64□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 ZNF79Q15937 498 aa10.64□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 CCDC190Q86UF4 302 aa10.64□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 SLC38A6Q8IZM9 456 aa10.64□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 OR4C16Q8NGL9 310 aa10.64□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 TERB2Q8NHR7 220 aa10.64□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 CD300LFQ8TDQ1 290 aa10.64□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 HIPK2Q9H2X6 1198 aa10.64□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa10.64□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 OR11H12B2RN74 326 aa10.63□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 BMPR1BO00238 502 aa10.63□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 GGCTO75223 188 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 KRASP01116 189 aa10.63□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 IGKV1-39P01597 117 aa10.63□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 PRH1P02810 166 aa10.63□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 IGKV1D-39P04432 117 aa10.63□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 PGAM2P15259 253 aa10.63□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 PPP5CP53041 499 aa10.63□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 RPL8P62917 257 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 C15orf32Q32M92 178 aa10.63□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 ANKRD55Q3KP44 614 aa10.63□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa10.63□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 C19orf35Q6ZS72 473 aa10.63□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 TTC9CQ8N5M4 171 aa10.63□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 MARCH1Q8TCQ1 289 aa10.63□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 SRD5A3Q9H8P0 318 aa10.63□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 HRASLSQ9HDD0 168 aa10.63□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 SLC2A9Q9NRM0 540 aa10.63□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 TMEM140Q9NV12 185 aa10.63□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 COMMD9Q9P000 198 aa10.63□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa10.62□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 IZUMO1RA6ND01 250 aa10.62□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 AKAIN1P0CW23 69 aa10.62□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 HLA-GP17693 338 aa10.62□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 MAS1LP35410 378 aa10.62□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 G6PCP35575 357 aa10.62□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 MECP2P51608 486 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 RND3P61587 244 aa10.62□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 ZNF45Q02386 682 aa10.62□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 FAM106AQ4KMX7 169 aa10.62□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 DMBX1Q8NFW5 382 aa10.62□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 OR13C8Q8NGS7 320 aa10.62□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 OR4A5Q8NH83 315 aa10.62□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 AIFM2Q9BRQ8 373 aa10.62□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 MARCH11A6NNE9 402 aa10.61□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 LGALS9O00182 355 aa10.61□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 OR2J3O76001 311 aa10.61□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 FOLR2P14207 255 aa10.61□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 AREGP15514 252 aa10.61□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 S100A5P33763 92 aa10.61□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 ARL3P36405 182 aa10.61□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 PIGPP57054 158 aa10.61□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 MEF2DQ14814 521 aa10.61□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 DEFB114Q30KQ6 69 aa10.61□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 PYDC2Q56P42 97 aa10.61□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 OR51S1Q8NGJ8 323 aa10.61□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 TRIM63Q969Q1 353 aa10.61□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa10.61□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 TP53RKQ96S44 253 aa10.61□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 FAM110AQ9BQ89 295 aa10.61□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 RETNQ9HD89 108 aa10.61□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 FBXL7Q9UJT9 491 aa10.61□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 NSG2Q9Y328 171 aa10.61□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa10.6□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 C2orf70A6NJV1 201 aa10.6□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 DBX1A6NMT0 343 aa10.6□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 DISC1C4P0D8 188 aa10.6□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 DEFA4P12838 97 aa10.6□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP10.6□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 OR2B8PP59922 312 aa10.6□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 SP6Q3SY56 376 aa10.6□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 DEFB125Q8N687 156 aa10.6□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 OR10W1Q8NGF6 305 aa10.6□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 OR52B4Q8NGK2 314 aa10.6□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 SEC22AQ96IW7 307 aa10.6□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 NDUFA13Q9P0J0 144 aa10.6□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 GPR132Q9UNW8 380 aa10.6□□□□□ -0.71
CITED1-202ENST00000373619 ZNF320A2RRD8 509 aa10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 120.6 ms