RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355765.10

PRPF39-201, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRPF39, Length 2,868 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-201ENST00000355765 WNT9BO14905 357 aa15.63■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 PLP2Q04941 152 aa15.63■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 TIGITQ495A1 244 aa15.63■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 CLCF1Q9UBD9 225 aa15.63■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 LY96Q9Y6Y9 160 aa15.63■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 PINLYPA6NC86 204 aa15.63■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 HAND1O96004 215 aa15.63■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 MT-CO2P00403 227 aa15.63■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 REG1AP05451 166 aa15.63■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 GABRA2P47869 451 aa15.63■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 SELENOVP59797 346 aa15.63■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 OCIAD2Q56VL3 154 aa15.63■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 OR4A47Q6IF82 309 aa15.63■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 OR4A16Q8NH70 328 aa15.63■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 WASHC3Q9Y3C0 194 aa15.63■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 DNAJC13O75165 2243 aa15.63■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa15.62■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 IGHV3-13P01766 116 aa15.62■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 IGHV3-7P01780 117 aa15.62■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 SMIM15Q7Z3B0 74 aa15.62■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 PRSS46E5RG02 174 aa15.62■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 PNKDQ8N490 385 aa15.62■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 SLC24A4Q8NFF2 622 aa15.62■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 FAM122AQ96E09 287 aa15.62■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 RTL8AQ9BWD3 113 aa15.62■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 UBE2G1P62253 170 aa15.61■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 RPL8P62917 257 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 ARG2P78540 354 aa15.61■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 ALKBH6Q3KRA9 238 aa15.61■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 GCNT2Q8N0V5 402 aa15.61■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 FAM216AQ8WUB2 273 aa15.61■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 OSTCQ9NRP0 149 aa15.61■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 H0YJW9 148 aa15.61■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 OR10J4P0C629 311 aa15.61■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 CA7P43166 264 aa15.61■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 ERVK11-1P61568 191 aa15.61■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 SPACA3Q8IXA5 215 aa15.61■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 Q8TCH9 128 aa15.61■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 DCTN5Q9BTE1 182 aa15.61■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 TAX1BP3O14907 124 aa15.61■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 GFRA3O60609 400 aa15.61■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 IGFBP2P18065 325 aa15.61■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 FOXF2Q12947 444 aa15.61■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa15.61■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 NUDT3O95989 172 aa15.6■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 CELA3BP08861 270 aa15.6■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 NRN1LQ496H8 165 aa15.6■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa15.6■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 Q6ZR03 302 aa15.6■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF826PQ6ZT77 177 aa15.6■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 NPVFQ9HCQ7 196 aa15.6■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 NUDT10Q8NFP7 164 aa15.6■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 TMEM45BQ96B21 275 aa15.6■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 IL19Q9UHD0 177 aa15.6■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 LINC00869P0C866 280 aa15.59■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF146Q15072 292 aa15.59■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 GDF5OSQ5U4N7 250 aa15.59■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 TEPPQ6URK8 271 aa15.59■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 OR8B3Q8NGG8 313 aa15.59■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 OR8B2Q96RD0 313 aa15.59■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa15.59■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 OOEPA6NGQ2 149 aa15.59■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 OR7C2O60412 319 aa15.59■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 MFAP2P55001 183 aa15.59■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 TBR1Q16650 682 aa15.59■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 LRRC10Q5BKY1 277 aa15.59■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 COQ2Q96H96 371 aa15.59■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa15.59■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa15.59■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa15.58■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 MUC21A0A140T8X8 626 aa15.58■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 hDV102S1A0JD36 115 aa15.58■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 C2orf70A6NJV1 201 aa15.58■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 GGTLC3B5MD39 225 aa15.58■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 IGLV2-8P01709 118 aa15.58■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 CELA3AP09093 270 aa15.58■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 OR1C1Q15619 314 aa15.58■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 MUC21Q5SSG8 566 aa15.58■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 LINC00479Q96M42 142 aa15.58■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 TNFRSF19Q9NS68 423 aa15.58■□□□□ 0.09
PRPF39-201ENST00000355765 COX19Q49B96 90 aa15.58■□□□□ 0.08
PRPF39-201ENST00000355765 OR13A1Q8NGR1 328 aa15.58■□□□□ 0.08
PRPF39-201ENST00000355765 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
PRPF39-201ENST00000355765 IZUMO1RA6ND01 250 aa15.58■□□□□ 0.08
PRPF39-201ENST00000355765 ISLRO14498 428 aa15.58■□□□□ 0.08
PRPF39-201ENST00000355765 AREGP15514 252 aa15.58■□□□□ 0.08
PRPF39-201ENST00000355765 ARR3P36575 388 aa15.58■□□□□ 0.08
PRPF39-201ENST00000355765 RHOGP84095 191 aa15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms