RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336128.11

ZNF548-201, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF548, Length 2,115 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-201ENST00000336128 C10orf55Q5SWW7 151 aa10.03□□□□□ -0.8
ZNF548-201ENST00000336128 TREML4Q6UXN2 200 aa10.03□□□□□ -0.8
ZNF548-201ENST00000336128 TEX45Q8NA69 505 aa10.03□□□□□ -0.8
ZNF548-201ENST00000336128 CLDND2Q8NHS1 167 aa10.03□□□□□ -0.8
ZNF548-201ENST00000336128 RARRES2Q99969 163 aa10.03□□□□□ -0.8
ZNF548-201ENST00000336128 SPOCK3Q9BQ16 436 aa10.03□□□□□ -0.8
ZNF548-201ENST00000336128 A0A1W2PN81 502 aa10.02□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa10.02□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 CGB1A6NKQ9 187 aa10.02□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 INS-IGF2F8WCM5 200 aa10.02□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 MPDU1O75352 247 aa10.02□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 CNTFRP26992 372 aa10.02□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 CHRNA7P36544 502 aa10.02□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 PDLIM4P50479 330 aa10.02□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 LCN2P80188 198 aa10.02□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 BTN1A1Q13410 526 aa10.02□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 HAGHQ16775 308 aa10.02□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 BSXQ3C1V8 233 aa10.02□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa10.02□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 VMO1Q7Z5L0 202 aa10.02□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 CCL19Q99731 98 aa10.02□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa10.02□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 DPM3Q9P2X0 92 aa10.02□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 KPTNQ9Y664 436 aa10.02□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 E7EUB6 86 aa10.01□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 CRYGBP07316 175 aa10.01□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 PSG5Q15238 335 aa10.01□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF506Q5JVG8 444 aa10.01□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 OR10G4Q8NGN3 311 aa10.01□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 OR10G9Q8NGN4 311 aa10.01□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 OR10G7Q8NGN6 311 aa10.01□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 MGST2Q99735 147 aa10.01□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 IGSF10Q6WRI0 2623 aa10.01□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 USP24Q9UPU5 2620 aa10.01□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa10.01□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 A0A1W2PRD5 423 aa10.01□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 A0A1W2PRF3 423 aa10.01□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 A0A1W2PRM7 423 aa10.01□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 TIMM23O14925 209 aa10.01□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP10.01□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 CEACAM3P40198 252 aa10.01□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 LMO4P61968 165 aa10.01□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 ERHP84090 104 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 PAX2Q02962 417 aa10.01□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 ICAM4Q14773 271 aa10.01□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 PRSS8Q16651 343 aa10.01□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 FAM122CQ6P4D5 195 aa10.01□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 C1orf159Q96HA4 380 aa10.01□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 GGTLC1Q9BX51 225 aa10.01□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 SMDT1Q9H4I9 107 aa10.01□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 SLC25A22Q9H936 323 aa10.01□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 NPVFQ9HCQ7 196 aa10.01□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa10□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa10□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 FNDC10F2Z333 226 aa10□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 M6PRP20645 277 aa10□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 OPRK1P41145 380 aa10□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa10□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 MMD2Q8IY49 270 aa10□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 SIRPDQ9H106 197 aa10□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 SLC35B3Q9H1N7 401 aa10□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 SLC39A9Q9NUM3 307 aa10□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 GNG13Q9P2W3 67 aa10□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 CACNA1BQ00975 2339 aa10□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 SOX15O60248 233 aa10□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 SNAPINO95295 136 aa10□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 WT1-ASQ06250 92 aa10□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 SIGLEC9Q9Y336 463 aa10□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 HILPDAQ9Y5L2 63 aa10□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 PXMP4Q9Y6I8 212 aa10□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 VENTXO95231 258 aa9.99□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 OR13C7P0DN81 318 aa9.99□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 NPBWR1P48145 328 aa9.99□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 MIC13Q5XKP0 118 aa9.99□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 SUN5Q8TC36 379 aa9.99□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 RXFP4Q8TDU9 374 aa9.99□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 CFHR4Q92496 578 aa9.99□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 RNF5Q99942 180 aa9.99□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 KCNIP2Q9NS61 270 aa9.99□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 CYB5BO43169 146 aa9.98□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 YIF1AO95070 293 aa9.98□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 SRP19P09132 144 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 MAS1LP35410 378 aa9.98□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 TNXAQ16473 311 aa9.98□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 KHDC3LQ587J8 217 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms