RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262605.8

TTPAL-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-201ENST00000262605 TIMM23O14925 209 aa8.51□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 BSXQ3C1V8 233 aa8.51□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 DNM1P46Q6ZS02 220 aa8.51□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa8.51□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 C11orf53Q8IXP5 236 aa8.51□□□□□ -1.05
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TTPAL-201ENST00000262605 C7orf69Q9H7B7 122 aa8.51□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
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TTPAL-201ENST00000262605 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
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TTPAL-201ENST00000262605 NHLRC2Q8NBF2 726 aa8.5□□□□□ -1.05
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TTPAL-201ENST00000262605 PF4V1P10720 104 aa8.5□□□□□ -1.05
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TTPAL-201ENST00000262605 RNF2Q99496 336 aa8.5□□□□□ -1.05
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TTPAL-201ENST00000262605 CYTL1Q9NRR1 136 aa8.5□□□□□ -1.05
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TTPAL-201ENST00000262605 SHISA9B4DS77 424 aa8.49□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 RRHO14718 337 aa8.49□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 MDKP21741 143 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 FAM74A3Q4VXF1 159 aa8.49□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 HEPN1Q6WQI6 88 aa8.49□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 Q6ZS49 121 aa8.49□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF383Q8NA42 475 aa8.49□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 G3V3Q6 166 aa8.49□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 LYPD6Q86Y78 171 aa8.49□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 WFDC3Q8IUB2 231 aa8.49□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 NABP2Q9BQ15 211 aa8.49□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 CLDN34H7C241 214 aa8.49□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 MPDU1O75352 247 aa8.49□□□□□ -1.05
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TTPAL-201ENST00000262605 CTRB1P17538 263 aa8.49□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 CTRB2Q6GPI1 263 aa8.49□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 NDFIP1Q9BT67 221 aa8.49□□□□□ -1.05
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TTPAL-201ENST00000262605 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa8.49□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 EFNA4P52798 201 aa8.49□□□□□ -1.05
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TTPAL-201ENST00000262605 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 ESPL1Q14674 2120 aa8.49□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 HELTA6NFD8 242 aa8.49□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa8.49□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 WNT2P09544 360 aa8.49□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 CHEK1O14757 476 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 PDE6DO43924 150 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 TGFAP01135 160 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 RD3LP0DJH9 198 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 C3orf36Q3SXR2 165 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 GCSAMLQ5JQS6 135 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 TMEM37Q8WXS4 190 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 BPESC1Q9GZL8 116 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 BDP1A6H8Y1 2624 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa8.48□□□□□ -1.05
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TTPAL-201ENST00000262605 PPP1R2P9O14990 202 aa8.48□□□□□ -1.05
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TTPAL-201ENST00000262605 LMO1P25800 156 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF585BQ52M93 769 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 NAGKQ9UJ70 344 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 IGKV1-16P04430 117 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 XIRP2A4UGR9 3374 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 CCKARP32238 428 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 C17orf58Q2M2W7 97 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 TRAV40A0A0B4J280 105 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 LOXL3P58215 753 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 RPEL1Q2QD12 228 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 OR4A5Q8NH83 315 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 TRANK1O15050 2925 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 RAB4AP20338 218 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 FAM210BQ96KR6 192 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-201ENST00000262605 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa8.47□□□□□ -1.05
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