RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 MDKP21741 143 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 EFNA4P52798 201 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 PRR18Q8N4B5 295 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB1CQ92928 201 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 NPCDR1Q9BY65 106 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 MS4A5Q9H3V2 200 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 CSPG4Q6UVK1 2322 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 TMPRSS2O15393 492 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 IQCJQ1A5X6 159 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 SCCPDHQ8NBX0 429 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 DTD1Q8TEA8 209 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB1BQ9H0U4 201 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 TLN2Q9Y4G6 2542 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM210A6NLX4 147 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 ST8SIA5O15466 376 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 CLEC12BQ2HXU8 276 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 NECAP1Q8NC96 275 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PPQ1 181 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 F6UZH7 168 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 MLNRO43193 412 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV1-46P01743 117 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF664Q8N3J9 261 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 ODAMA1E959 279 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 OOEPA6NGQ2 149 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 NXPH2O95156 264 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC35E4Q6ICL7 350 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 COL8A2P25067 703 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 SSX2Q16385 188 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 TUBG2Q9NRH3 451 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 SELEP16581 610 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 CNN1P51911 297 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 HNF4GQ14541 408 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 PRSS57Q6UWY2 283 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNIP2Q9NS61 270 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 C11orf94C9JXX5 98 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 PAGE4O60829 102 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 MPDU1O75352 247 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 KRASP01116 189 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 FOXL1Q12952 345 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2Z1Q8NG97 314 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 FUT9Q9Y231 359 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 MTORP42345 2549 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAV39A0A0B4J263 110 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 IQCF6A8MYZ5 107 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 G6PCP35575 357 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM216AQ8WUB2 273 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2D2Q9H210 308 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 CLN8Q9UBY8 286 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 RPP30P78346 268 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa21.58■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR86Q86TI4 376 aa21.58■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 HES4Q9HCC6 221 aa21.58■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 HAND1O96004 215 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 SPCS3P61009 180 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 GBGT1Q8N5D6 347 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 ELOVL1Q9BW60 279 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 RAMP3O60896 148 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM37Q8WXS4 190 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM144Q7Z5S9 345 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC01551Q86U37 167 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 DCAF16Q9NXF7 216 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR83OSQ9Y284 106 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 AARDQ4LEZ3 155 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 S1PR2O95136 353 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM168AQ92567 244 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 MISP3Q96FF7 219 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 CR1P17927 2039 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 DYSFO75923 2080 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 C12orf77C9JDV5 145 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF223E7ERA6 249 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 OR3A1P47881 315 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 RPL15P61313 204 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 RPL30P62888 115 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAT1Q6PIZ9 186 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 CLEC2AQ6UVW9 174 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 C10orf105Q8TEF2 133 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 SAP30LQ9HAJ7 183 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 CDIPTO14735 213 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 NDUFB7P17568 137 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 OR1L1Q8NH94 360 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 GATAD1Q8WUU5 269 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 ITLN1Q8WWA0 313 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2V2Q96R30 315 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 PXMP4Q9Y6I8 212 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 IL3RAP26951 378 aa21.53■■□□□ 1.04
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