RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 ST20Q9HBF5 79 aa17.58■□□□□ 0.41
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ODC1-201ENST00000234111 COMMD5Q9GZQ3 224 aa17.53■□□□□ 0.4
ODC1-201ENST00000234111 J3QR06 171 aa17.53■□□□□ 0.4
ODC1-201ENST00000234111 PSPNO60542 156 aa17.53■□□□□ 0.4
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ODC1-201ENST00000234111 OR4A16Q8NH70 328 aa17.52■□□□□ 0.39
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ODC1-201ENST00000234111 FAM216AQ8WUB2 273 aa17.51■□□□□ 0.39
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ODC1-201ENST00000234111 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
ODC1-201ENST00000234111 CRXO43186 299 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
ODC1-201ENST00000234111 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
ODC1-201ENST00000234111 ZNF503Q96F45 646 aa17.5■□□□□ 0.39
ODC1-201ENST00000234111 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
ODC1-201ENST00000234111 SCRT2Q9NQ03 307 aa17.5■□□□□ 0.39
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