RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000046257.13

Sptan1-201, Transcript of Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sptan1, Length 7,820 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Scnm1Q8K136 229 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Eif3iQ9QZD9 325 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 FcmrA1KXC4 422 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Ms4a18J3QN01 344 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Wnt1P04426 370 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Ca10P61215 328 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 HfeP70387 359 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Smad4P97471 551 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Olfr324Q5NCC7 333 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Gp49aQ61450 303 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Prdx6bQ8BG37 224 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Rer1Q9CQU3 196 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Olfr1328B1ARV2 313 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Casp16-psI6L890 176 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Vmn1r194J3JS27 296 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Gabra1P62812 455 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Tmem217Q14AF1 189 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Adgrg5Q3V3Z3 524 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Arg1Q61176 323 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Ankrd9Q8BH83 326 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Mrpl43Q99N89 183 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 L3hypdhQ9CXA2 354 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Avpi1Q9D7H4 142 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Prss37Q9DAA4 237 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 NynrinQ5DTZ0 1840 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Trbv2A0A0B4J1G8 114 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 H2-LP01897 362 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Wnt5aP22725 380 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Mfap2P55002 183 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 DctdQ8K2D6 178 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Olfr483Q8VG05 315 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Olfr934Q9EQ87 310 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Sfrp5Q9WU66 314 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Gm12887B1AVM1 119 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Hoxd4P10628 250 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 ArsaP50428 506 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Gm21943Q5FWD5 227 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Fam57aQ5ND56 257 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Tusc5Q8C838 173 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 FevQ8QZW2 237 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Mfap4Q9D1H9 257 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Ackr1Q9QUI6 334 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Fbxl6Q9QXW0 535 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Olfr175-ps1A0A140T8K4 308 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Dmrtb1A2A9I7 359 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Olfr152G3X9L8 316 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Cited2O35740 269 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Trav8d-1Q5R1H8 112 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 HaaoQ78JT3 286 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 GhitmQ91VC9 346 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 MmdQ9CQY7 238 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Gm21913J3KML9 361 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Gm21732J3QM79 361 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Gm21921J3QNB5 361 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Gm21776J3QPJ5 361 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Sumo2P61957 95 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Olfr153Q7TR48 307 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Olfr873Q8VFJ0 319 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Olfr435Q8VFS3 313 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Pbp2Q8VIN1 187 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Q9DAD0 168 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 SelenofQ9ERR7 162 aa7.5□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Ldlrad3A2AR95 345 aa7.49□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Scgb1b3J3QJY4 93 aa7.49□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Vmn1r128L7N2B4 307 aa7.49□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 FhitO89106 150 aa7.49□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Atf1P81269 269 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 ShbgP97497 403 aa7.49□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 1700009N14RikQ14AA6 216 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Olfr1026Q7TR90 307 aa7.49□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Tmem127Q8BGP5 238 aa7.49□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Prss58Q8BW11 241 aa7.49□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Ssmem1Q9D9Y8 244 aa7.49□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Sh2d2aQ9QXK9 374 aa7.49□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Gm14444A2ARW3 426 aa7.49□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Olfr288E9Q1P2 318 aa7.49□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 BokO35425 213 aa7.49□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Ubtd2Q6PGH0 234 aa7.49□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Kctd12Q6WVG3 327 aa7.49□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Olfr904Q7TRC9 310 aa7.49□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Fam206aQ80ZQ9 193 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 C1rbQ8CFG9 706 aa7.49□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Mbnl3Q8R003 342 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Il36aQ9JLA2 160 aa7.49□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Mmp17Q9R0S3 578 aa7.49□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Igkv4-91A0A075B5L2 119 aa7.49□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Ighv7-1A0A075B5S2 121 aa7.49□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Ascl5M0QWB7 188 aa7.49□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Sssca1P56873 199 aa7.49□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Trappc1Q5NCF2 145 aa7.49□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 GcsamQ6RFH4 181 aa7.49□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Defa22Q8C1N8 93 aa7.49□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Sval2Q99N75 144 aa7.49□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Mrps16Q9CPX7 135 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Alkbh7Q9D6Z0 221 aa7.49□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Ctag2Q9D9S4 219 aa7.49□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Greb1lB9EJV3 1913 aa7.49□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Vsig10l2A0A140LHF2 776 aa7.49□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Gm20918J3QN17 227 aa7.49□□□□□ -1.21
Sptan1-201ENSMUST00000046257 Pdcd6P12815 191 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 37 ms