RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628742.2

SOX9-AS1-218, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 733 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-218ENST00000628742 AGRNO00468 2067 aa4.9□□□□□ -1.62
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ERICH4A6NGS2 130 aa4.9□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 OR4C46A6NHA9 309 aa4.9□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 C15orf62A8K5M9 175 aa4.9□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 MFNGO00587 321 aa4.9□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ATP5HO75947 161 aa4.9□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SLC22A5O76082 557 aa4.9□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 DHFRP00374 187 aa4.9□□□□□ -1.63
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SOX9-AS1-218ENST00000628742 AREGP15514 252 aa4.9□□□□□ -1.63
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SOX9-AS1-218ENST00000628742 WNT4P56705 351 aa4.9□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ST3GAL4Q11206 333 aa4.9□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CBX3Q13185 183 aa4.9□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 INSL4Q14641 139 aa4.9□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ACSM3Q53FZ2 586 aa4.9□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CLEC19AQ6UXS0 136 aa4.9□□□□□ -1.63
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SOX9-AS1-218ENST00000628742 OR10J5Q8NHC4 309 aa4.9□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 VSTM2AQ8TAG5 236 aa4.9□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa4.9□□□□□ -1.63
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SOX9-AS1-218ENST00000628742 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
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SOX9-AS1-218ENST00000628742 KCNK15Q9H427 330 aa4.9□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
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SOX9-AS1-218ENST00000628742 TRAV2A0A0B4J234 112 aa4.89□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 HMX3A6NHT5 357 aa4.89□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 C15orf61A6NNL5 157 aa4.89□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 MPTX1A8MV57 137 aa4.89□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 RAB27BO00194 218 aa4.89□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 NDUFA4O00483 81 aa4.89□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TGOLN2O43493 480 aa4.89□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 IFNA4P05014 189 aa4.89□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CD3GP09693 182 aa4.89□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 GSTT2P0CG29 244 aa4.89□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 GSTT2BP0CG30 244 aa4.89□□□□□ -1.63
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SOX9-AS1-218ENST00000628742 MED21Q13503 144 aa4.89□□□□□ -1.63
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SOX9-AS1-218ENST00000628742 ZNF645Q8N7E2 425 aa4.89□□□□□ -1.63
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SOX9-AS1-218ENST00000628742 OR4A5Q8NH83 315 aa4.89□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ACOT12Q8WYK0 555 aa4.89□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 OR2A7Q96R45 310 aa4.89□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 RARRES2Q99969 163 aa4.89□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa4.88□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ZNF320A2RRD8 509 aa4.88□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PRSS29PA6NIE9 313 aa4.88□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 MPPED1O15442 326 aa4.88□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ACTL6BO94805 426 aa4.88□□□□□ -1.63
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SOX9-AS1-218ENST00000628742 RBMY1CP0DJD4 496 aa4.88□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 DTYMKP23919 212 aa4.88□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 RPL8P62917 257 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.88□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa4.88□□□□□ -1.63
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SOX9-AS1-218ENST00000628742 POM121L12Q8N7R1 296 aa4.88□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa4.88□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 OR11H2Q8NH07 326 aa4.88□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 OR4S2Q8NH73 311 aa4.88□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CD300LFQ8TDQ1 290 aa4.88□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SMPXQ9UHP9 88 aa4.88□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 OR2W1Q9Y3N9 320 aa4.88□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa4.87□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa4.87□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 NPIPB6E9PJ23 425 aa4.87□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 BET1O15155 118 aa4.87□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 DFFBO76075 338 aa4.87□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CD5P06127 495 aa4.87□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CTSGP08311 255 aa4.87□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 IGKV1-13P0DP09 117 aa4.87□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 MIFP14174 115 aa4.87□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 HLA-GP17693 338 aa4.87□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 GPR183P32249 361 aa4.87□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 RANBP1P43487 201 aa4.87□□□□□ -1.63
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