RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610468.4

MUC1-222, Transcript of mucin 1, cell surface associated, human

TSL 1 (best)

Gene MUC1, Length 1,162 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC1-222	ENST00000610468	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		10.47	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	DEFB125	Q8N687	156 aa		10.47	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	BEST4	Q8NFU0	473 aa		10.47	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		10.47	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		10.47	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		10.47	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		10.47	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		10.47	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		10.46	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	SULT1C2	O00338	296 aa		10.46	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	FCGR3B	O75015	233 aa		10.46	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	OR2J3	O76001	311 aa		10.46	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	PRSS3	P35030	304 aa		10.46	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		10.46	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	KCTD9	Q7L273	389 aa		10.46	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	CCDC190	Q86UF4	302 aa		10.46	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	OR52I2	Q8NH67	350 aa		10.46	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		10.46	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		10.46	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		10.46	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		10.46	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		10.46	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468		V9GYH0	126 aa		10.46	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468		A0A1B0GW64	132 aa		10.45	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	OR11H12	B2RN74	326 aa		10.45	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	PPP5D1	E7EU14	171 aa		10.45	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	CTDSPL	O15194	276 aa		10.45	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	SLC22A5	O76082	557 aa		10.45	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	KBTBD11	O94819	623 aa		10.45	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	FCER2	P06734	321 aa		10.45	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	CTXN2	P0C2S0	81 aa		10.45	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	EDN2	P20800	178 aa		10.45	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	CBX5	P45973	191 aa		10.45	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		10.45	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	GPHB5	Q86YW7	130 aa		10.45	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		10.45	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		10.45	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	MCFD2	Q8NI22	146 aa		10.45	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		10.45	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		10.45	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	CCDC140	Q96MF4	163 aa		10.45	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		10.45	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		10.45	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		10.45	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	KLK11	Q9UBX7	282 aa		10.45	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		10.45	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		10.45	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM213	A2RRL7	107 aa		10.44	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	HMX3	A6NHT5	357 aa		10.44	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468		A8MWP6	167 aa		10.44	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	FAM25A	B3EWG3	89 aa		10.44	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	FAM25C	B3EWG5	89 aa		10.44	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	FAM25G	B3EWG6	89 aa		10.44	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	OR2C1	O95371	312 aa		10.44	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	CRYGC	P07315	174 aa		10.44	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF735	P0CB33	412 aa		10.44	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	CBLN1	P23435	193 aa		10.44	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	RFX2	P48378	723 aa		10.44	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF79	Q15937	498 aa		10.44	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		10.44	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		10.44	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	OR4S2	Q8NH73	311 aa		10.44	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		10.44	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	OR2A7	Q96R45	310 aa		10.44	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		10.44	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	CCDC160	A6NGH7	325 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468		E7EUB6	86 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	CD74	P04233	296 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	MAS1L	P35410	378 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	GUCA2B	Q16661	112 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	TSC22D3	Q99576	134 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	GABARAP	H6UMI1	98 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	RGS5	O15539	181 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	NDUFB8	O95169	186 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	AREG	P15514	252 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	CTRB1	P17538	263 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	PSMB6	P28072	239 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	ETV6	P41212	452 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MUC1-222	ENST00000610468	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		10.42	□□□□□ -0.74

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