RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 SLC35E1Q96K37 410 aa9.33□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 MAGT1Q9H0U3 335 aa9.33□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 HIF3AQ9Y2N7 669 aa9.33□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 WSB1Q9Y6I7 421 aa9.33□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 VPS13DQ5THJ4 4388 aa9.32□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 FAT2Q9NYQ8 4349 aa9.32□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 A0A1W2PRD5 423 aa9.32□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 A0A1W2PRF3 423 aa9.32□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 A0A1W2PRM7 423 aa9.32□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 C5orf49A4QMS7 147 aa9.32□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 SYNGR1O43759 233 aa9.32□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 BPNT1O95861 308 aa9.32□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 TXNDC12O95881 172 aa9.32□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 RPL29P47914 159 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 SOX2P48431 317 aa9.32□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 PTTG1IPP53801 180 aa9.32□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 RND3P61587 244 aa9.32□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 PAFAH1B2P68402 229 aa9.32□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 ZNF266Q14584 549 aa9.32□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 ICAM4Q14773 271 aa9.32□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 SPSB3Q6PJ21 355 aa9.32□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 PET117Q6UWS5 81 aa9.32□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 LINC00114Q6XXX2 140 aa9.32□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 OR5AU1Q8NGC0 362 aa9.32□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 OR4D6Q8NGJ1 314 aa9.32□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 ABHD14BQ96IU4 210 aa9.32□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 OR10C1Q96KK4 312 aa9.32□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 Q96M85 177 aa9.32□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 AGMATQ9BSE5 352 aa9.32□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 CABLES2Q9BTV7 478 aa9.32□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 ALG12Q9BV10 488 aa9.32□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 C5orf66Q9H5L9 145 aa9.32□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 SLC2A9Q9NRM0 540 aa9.32□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 A0A0B4J2E0 115 aa9.31□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 A0A1B0GX12 115 aa9.31□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 TMEM238C9JI98 176 aa9.31□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 F6UZH7 168 aa9.31□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 PFN1P07737 140 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 PGA3P0DJD8 388 aa9.31□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 Q6ZS46 218 aa9.31□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 MOGAT3Q86VF5 341 aa9.31□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 LYPD6Q86Y78 171 aa9.31□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 ZNF440Q8IYI8 595 aa9.31□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 Q8N7P7 452 aa9.31□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 MARCH1Q8TCQ1 289 aa9.31□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 TP53RKQ96S44 253 aa9.31□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 TM2D3Q9BRN9 247 aa9.31□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 FAM234AQ9H0X4 552 aa9.31□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 CSTL1Q9H114 145 aa9.31□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 WDR76Q9H967 626 aa9.31□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 Q9N2K0 584 aa9.31□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 GPR84Q9NQS5 396 aa9.31□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 HSPG2P98160 4391 aa9.31□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa9.3□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa9.3□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 ZNF732B4DXR9 585 aa9.3□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 GYPBP06028 91 aa9.3□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 ESDP10768 282 aa9.3□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 HRH1P35367 487 aa9.3□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 S100A10P60903 97 aa9.3□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 IL24Q13007 206 aa9.3□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 MAJINQ3KP22 176 aa9.3□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 ANKRD55Q3KP44 614 aa9.3□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 ACTL10Q5JWF8 245 aa9.3□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 C16orf54Q6UWD8 224 aa9.3□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 LY6G5BQ8NDX9 201 aa9.3□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 OR4K13Q8NH42 304 aa9.3□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 Q8TCH9 128 aa9.3□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 LIPHQ8WWY8 451 aa9.3□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 ZMAT4Q9H898 229 aa9.3□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 SDF2L1Q9HCN8 221 aa9.3□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 GRHPRQ9UBQ7 328 aa9.3□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 SLC7A11Q9UPY5 501 aa9.3□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa9.3□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa9.3□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa9.29□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 TRAV27A0A087WT01 109 aa9.29□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa9.29□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 LRRC30A6NM36 301 aa9.29□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 YPEL1O60688 119 aa9.29□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 SCGB1D1O95968 90 aa9.29□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 ALOX5APP20292 161 aa9.29□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 DTYMKP23919 212 aa9.29□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 HSD11B1P28845 292 aa9.29□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 THBS3P49746 956 aa9.29□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 UBE2E1P51965 193 aa9.29□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 CEBPGP53567 150 aa9.29□□□□□ -0.92
HCG18-241ENST00000602290 TAS2R46P59540 309 aa9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms