RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591107.6

NPC1-212, Transcript of NPC intracellular cholesterol transporter 1, human

TSL 3

Gene NPC1, Length 890 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPC1-212	ENST00000591107	PIGP	P57054	158 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	ZNF616	Q08AN1	781 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	TATDN3	Q17R31	274 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	ARPC1A	Q92747	370 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	C5orf30	Q96GV9	206 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	NABP2	Q9BQ15	211 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	OR51J1	Q9H342	316 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	ZNF221	Q9UK13	617 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	ALG5	Q9Y673	324 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107		A0A087WW49	117 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107		A0A1W2PN81	502 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	TNFSF12	O43508	249 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	PRAF2	O60831	178 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	IGLV2-14	P01704	120 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	IGHV3-11	P01762	117 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	IL5	P05113	134 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	OR4E1	P0C645	316 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	OR8U8	P0C7N1	319 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	CHRNA7	P36544	502 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	PPP1R1A	Q13522	171 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	C4orf46	Q504U0	113 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	CASC10	Q5T4H9	136 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	TMEM65	Q6PI78	240 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	BVES	Q8NE79	360 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	MUC7	Q8TAX7	377 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	GPHA2	Q96T91	129 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	C7orf66	A4D0T2	115 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	C3orf84	H3BNL1	204 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	OVOL1	O14753	267 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	NBR2	O15453	112 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	SLC22A5	O76082	557 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	IGLV1-40	P01703	118 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	HLA-DRB1	P01911	266 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	S100G	P29377	79 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	RND3	P61587	244 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	DHODH	Q02127	395 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	CBX3	Q13185	183 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	MSMO1	Q15800	293 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	FBXL15	Q9H469	300 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	NAA60	Q9H7X0	242 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	GAB2	Q9UQC2	676 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	C9orf170	A2RU37	121 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	RAB29	O14966	203 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	SFT2D2	O95562	160 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	RAB9A	P51151	201 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	DEFA5	Q01523	94 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	LYG2	Q86SG7	212 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NPC1-212	ENST00000591107	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		10.21	□□□□□ -0.78
NPC1-212	ENST00000591107	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.78
NPC1-212	ENST00000591107		M0R1X1	148 aa		10.2	□□□□□ -0.78
NPC1-212	ENST00000591107	FCN1	O00602	326 aa		10.2	□□□□□ -0.78
NPC1-212	ENST00000591107	MPPED1	O15442	326 aa		10.2	□□□□□ -0.78
NPC1-212	ENST00000591107	GP9	P14770	177 aa		10.2	□□□□□ -0.78
NPC1-212	ENST00000591107	DHRS2	Q13268	280 aa		10.2	□□□□□ -0.78
NPC1-212	ENST00000591107	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
NPC1-212	ENST00000591107	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		10.2	□□□□□ -0.78
NPC1-212	ENST00000591107	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		10.2	□□□□□ -0.78
NPC1-212	ENST00000591107	LILRB2	Q8N423	598 aa		10.2	□□□□□ -0.78

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