RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589727.5

ATP6V0A1-222, Transcript of ATPase H+ transporting V0 subunit a1, human

TSL 5

Gene ATP6V0A1, Length 664 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RFT1	Q96AA3	541 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FGGY	Q96C11	551 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TMEM212	A6NML5	194 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SNTN	A6NMZ2	147 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		H0YJW9	148 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	HTR1A	P08908	422 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SMIM18	P0DKX4	95 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TMEM225B	P0DP42	221 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DAP	P51397	102 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OXA1L	Q15070	435 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	KISS1	Q15726	138 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MPV17L	Q2QL34	196 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TP53I3	Q53FA7	332 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	THTPA	Q9BU02	230 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	IL36G	Q9NZH8	169 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	HSF4	Q9ULV5	492 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RAB26	Q9ULW5	256 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		A0A1B0GVG6	124 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DAPL1	A0PJW8	107 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		G3V2T6	193 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CD2	P06729	351 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CT45A6	P0DMU7	189 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CT45A5	P0DMU8	189 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CT45A7	P0DMV0	189 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FCGR1A	P12314	374 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RAB3A	P20336	220 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	HSPA13	P48723	471 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DEFB131A	P59861	70 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF85	Q03923	595 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RSU1	Q15404	277 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ATP6AP1	Q15904	470 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	C6orf183	Q5T699	404 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SYS1	Q8N2H4	156 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	STX19	Q8N4C7	294 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GPER1	Q99527	375 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		S4R3C0	116 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GABRP	O00591	440 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CA11	O75493	328 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	HBZ	P02008	142 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RPA2	P15927	270 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GNRHR	P30968	328 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MAS1L	P35410	378 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DAD1	P61803	113 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MORN2	Q502X0	79 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MZT2A	Q6P582	158 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NFE4	Q86UQ8	179 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	S100A13	Q99584	98 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CIB1	Q99828	191 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		Q9H521	79 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	AASS	Q9UDR5	926 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	POMP	Q9Y244	141 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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