RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581536.5

TOP3A-211, Transcript of DNA topoisomerase III alpha, humanhuman

TSL 5

Gene TOP3A, Length 766 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3A-211ENST00000581536 GABARAPO95166 117 aa7.41□□□□□ -1.22
TOP3A-211ENST00000581536 NDUFB8O95169 186 aa7.41□□□□□ -1.22
TOP3A-211ENST00000581536 HPRT1P00492 218 aa7.41□□□□□ -1.22
TOP3A-211ENST00000581536 HRASP01112 189 aa7.41□□□□□ -1.22
TOP3A-211ENST00000581536 IGHV3-23P01764 117 aa7.41□□□□□ -1.22
TOP3A-211ENST00000581536 ZNF735P0CB33 412 aa7.41□□□□□ -1.22
TOP3A-211ENST00000581536 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
TOP3A-211ENST00000581536 LPAR6P43657 344 aa7.41□□□□□ -1.22
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TOP3A-211ENST00000581536 SYNJ2BPP57105 145 aa7.41□□□□□ -1.22
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TOP3A-211ENST00000581536 CD69Q07108 199 aa7.41□□□□□ -1.22
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TOP3A-211ENST00000581536 MSMO1Q15800 293 aa7.41□□□□□ -1.22
TOP3A-211ENST00000581536 ZNF585BQ52M93 769 aa7.41□□□□□ -1.22
TOP3A-211ENST00000581536 OR6F1Q8NGZ6 308 aa7.41□□□□□ -1.22
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TOP3A-211ENST00000581536 B9D2Q9BPU9 175 aa7.41□□□□□ -1.22
TOP3A-211ENST00000581536 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa7.41□□□□□ -1.22
TOP3A-211ENST00000581536 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
TOP3A-211ENST00000581536 FXYD6Q9H0Q3 95 aa7.41□□□□□ -1.22
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TOP3A-211ENST00000581536 HRASLSQ9HDD0 168 aa7.41□□□□□ -1.22
TOP3A-211ENST00000581536 KLK11Q9UBX7 282 aa7.41□□□□□ -1.22
TOP3A-211ENST00000581536 DMRT1Q9Y5R6 373 aa7.41□□□□□ -1.22
TOP3A-211ENST00000581536 M0QYG6 137 aa7.4□□□□□ -1.22
TOP3A-211ENST00000581536 CTDSP2O14595 271 aa7.4□□□□□ -1.22
TOP3A-211ENST00000581536 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
TOP3A-211ENST00000581536 RLN1P04808 185 aa7.4□□□□□ -1.22
TOP3A-211ENST00000581536 EDN2P20800 178 aa7.4□□□□□ -1.22
TOP3A-211ENST00000581536 KIR2DS2P43631 304 aa7.4□□□□□ -1.22
TOP3A-211ENST00000581536 TSPAN5P62079 268 aa7.4□□□□□ -1.22
TOP3A-211ENST00000581536 PHLDA2Q53GA4 152 aa7.4□□□□□ -1.22
TOP3A-211ENST00000581536 AADACL3Q5VUY0 350 aa7.4□□□□□ -1.22
TOP3A-211ENST00000581536 MZT2AQ6P582 158 aa7.4□□□□□ -1.22
TOP3A-211ENST00000581536 GPR141Q7Z602 305 aa7.4□□□□□ -1.22
TOP3A-211ENST00000581536 OR10W1Q8NGF6 305 aa7.4□□□□□ -1.22
TOP3A-211ENST00000581536 VSTM2AQ8TAG5 236 aa7.4□□□□□ -1.22
TOP3A-211ENST00000581536 FCAMRQ8WWV6 532 aa7.4□□□□□ -1.22
TOP3A-211ENST00000581536 OR4C12Q96R67 309 aa7.4□□□□□ -1.22
TOP3A-211ENST00000581536 ABHD1Q96SE0 405 aa7.4□□□□□ -1.22
TOP3A-211ENST00000581536 SLC2A9Q9NRM0 540 aa7.4□□□□□ -1.22
TOP3A-211ENST00000581536 BET1LQ9NYM9 111 aa7.4□□□□□ -1.22
TOP3A-211ENST00000581536 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
TOP3A-211ENST00000581536 NSG2Q9Y328 171 aa7.4□□□□□ -1.22
TOP3A-211ENST00000581536 SELENOKQ9Y6D0 94 aa7.4□□□□□ -1.22
TOP3A-211ENST00000581536 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa7.39□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 IZUMO1RA6ND01 250 aa7.39□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 PPP5D1E7EU14 171 aa7.39□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 BMPR1BO00238 502 aa7.39□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
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TOP3A-211ENST00000581536 CSN3P07498 182 aa7.39□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 GP9P14770 177 aa7.39□□□□□ -1.23
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TOP3A-211ENST00000581536 ZP3P21754 424 aa7.39□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 F2RP25116 425 aa7.39□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 PSMB6P28072 239 aa7.39□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 MAS1LP35410 378 aa7.39□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 G6PCP35575 357 aa7.39□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 TAS2R31P59538 309 aa7.39□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 TAS2R46P59540 309 aa7.39□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 OR2B8PP59922 312 aa7.39□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 RPL8P62917 257 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 CATR1Q13166 79 aa7.39□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 POU2AF1Q16633 256 aa7.39□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 C15orf32Q32M92 178 aa7.39□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa7.39□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 DMBX1Q8NFW5 382 aa7.39□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 OR52I2Q8NH67 350 aa7.39□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 CCDC140Q96MF4 163 aa7.39□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 TMEM140Q9NV12 185 aa7.39□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 EXTL2Q9UBQ6 330 aa7.39□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 FBXL7Q9UJT9 491 aa7.39□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 DPPA5A6NC42 116 aa7.38□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 NPIPB5A8MRT5 1133 aa7.38□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 GPR31O00270 319 aa7.38□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 OR2C1O95371 312 aa7.38□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 KRASP01116 189 aa7.38□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 IGKV1-39P01597 117 aa7.38□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 IGLV1-51P01701 117 aa7.38□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 CD3DP04234 171 aa7.38□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 IGKV1D-39P04432 117 aa7.38□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 CTRB1P17538 263 aa7.38□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 RPEL1Q2QD12 228 aa7.38□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 VAX1Q5SQQ9 334 aa7.38□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 CTRB2Q6GPI1 263 aa7.38□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 SLC25A42Q86VD7 318 aa7.38□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 Q8N1Y9 231 aa7.38□□□□□ -1.23
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